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游子8921铁杆木虫 (知名作家)
游子8921
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[求助]
请教初始结构优化问题
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优化一个体系初始结构，但是始终找不到。调整下结构优化有两种情况出现： 第一种：酚羟基上的H52被羧基上O16夺去，这样的结构应该是我想要的第一步反应的后一中间体，我想要前一中间体和过渡态。图1,2 第二种：调整使H52与酰胺基上O11形成氢键，但优化完后羧基跑开，离得较远.图3,4 我调了很多次H52位置和旋转酰胺基，都不行，想要得到不被脱质子的结构，请高手指教。 附有log文件：http://3721up.com/user/controlpanel/managefile.aspx     [ 来自科研家族 木虫量化 ] |
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4楼2011-09-11 21:39:52