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tlger

金虫 (小有名气)

[求助] 有关高聚物退火模拟的问题

1、对高聚物模拟必须进行退火模拟吗？
2、如果没退火，只达到局部最小化而不是全局最小化，这在最终的结果中能够看出来吗？
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1楼 2011-09-09 09:18:27
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yahoohoo

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
zh1987hs(金币+3): 谢谢 2011-09-13 07:43:03
引用回帖:
1楼: Originally posted by tlger at 2011-09-09 09:18:27:
1、对高聚物模拟必须进行退火模拟吗？
2、如果没退火，只达到局部最小化而不是全局最小化，这在最终的结果中能够看出来吗？

1. 取决于你考虑的体系。比如考虑高分子单链在溶液中的构象，普通的Monte Carlo或者MD就可以，不需要模拟退火。

2. 在大部分具有复杂势能面的体系中，很难达到全局最小值。同时也很难在严格意义上证明你达到全局最小值。
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2楼2011-09-10 01:40:57
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tlger

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yahoohoo at 2011-09-10 01:40:57:
1. 取决于你考虑的体系。比如考虑高分子单链在溶液中的构象，普通的Monte Carlo或者MD就可以，不需要模拟退火。

2. 在大部分具有复杂势能面的体系中，很难达到全局最小值。同时也很难在严格意义上证明你达到全 ...

对于第二种情况请问如何在md中退火模拟呢？
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3楼2011-09-11 13:01:41
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yahoohoo

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-09-13 07:43:13
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3楼: Originally posted by tlger at 2011-09-11 13:01:41:
对于第二种情况请问如何在md中退火模拟呢？

模拟退火利用的原理是高温下体系可以轻易地跨过自由能垒。在MD中，你可以使系统逐步极小幅度地降温。你可以比较由不同初始构象出发模拟的结果是否一致，从而预测是否达到能量最小。不过这仍然不是严格的证明。
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4楼2011-09-12 15:52:16
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tlger

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by yahoohoo at 2011-09-12 15:52:16:
模拟退火利用的原理是高温下体系可以轻易地跨过自由能垒。在MD中，你可以使系统逐步极小幅度地降温。你可以比较由不同初始构象出发模拟的结果是否一致，从而预测是否达到能量最小。不过这仍然不是严格的证明。

请问如何能够严格证明能量已经达到最小了
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5楼2011-09-13 15:33:49
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yahoohoo

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-09-13 18:11:16
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5楼: Originally posted by tlger at 2011-09-13 15:33:49:
请问如何能够严格证明能量已经达到最小了

我提到的是实际操作的方法，可能达到最小值。但是严格的证明几乎不可能，除非你已经知道体系确切的势能面（如果知道，那还要求最小值干嘛，矛盾）。
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6楼2011-09-13 15:37:38
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