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有关高聚物退火模拟的问题
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有关高聚物退火模拟的问题
1、对高聚物模拟必须进行退火模拟吗?
2、如果没退火,只达到局部最小化而不是全局最小化,这在最终的结果中能够看出来吗?
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1楼
2011-09-09 09:18:27
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4楼
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Originally posted by
yahoohoo
at 2011-09-12 15:52:16:
模拟退火利用的原理是高温下体系可以轻易地跨过自由能垒。在MD中,你可以使系统逐步极小幅度地降温。你可以比较由不同初始构象出发模拟的结果是否一致,从而预测是否达到能量最小。不过这仍然不是严格的证明。
请问如何能够严格证明能量已经达到最小了
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5楼
2011-09-13 15:33:49
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zh1987hs(金币+3): 谢谢 2011-09-13 07:43:03
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1楼
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tlger
at 2011-09-09 09:18:27:
1、对高聚物模拟必须进行退火模拟吗?
2、如果没退火,只达到局部最小化而不是全局最小化,这在最终的结果中能够看出来吗?
1. 取决于你考虑的体系。比如考虑高分子单链在溶液中的构象,普通的Monte Carlo或者MD就可以,不需要模拟退火。
2. 在大部分具有复杂势能面的体系中,很难达到全局最小值。同时也很难在严格意义上证明你达到全局最小值。
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2楼
2011-09-10 01:40:57
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2楼
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Originally posted by
yahoohoo
at 2011-09-10 01:40:57:
1. 取决于你考虑的体系。比如考虑高分子单链在溶液中的构象,普通的Monte Carlo或者MD就可以,不需要模拟退火。
2. 在大部分具有复杂势能面的体系中,很难达到全局最小值。同时也很难在严格意义上证明你达到全 ...
对于第二种情况请问如何在md中退火模拟呢?
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3楼
2011-09-11 13:01:41
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zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-09-13 07:43:13
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3楼
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tlger
at 2011-09-11 13:01:41:
对于第二种情况请问如何在md中退火模拟呢?
模拟退火利用的原理是高温下体系可以轻易地跨过自由能垒。在MD中,你可以使系统逐步极小幅度地降温。你可以比较由不同初始构象出发模拟的结果是否一致,从而预测是否达到能量最小。不过这仍然不是严格的证明。
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4楼
2011-09-12 15:52:16
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