24小时热门版块排行榜    

查看: 3125  |  回复: 11
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

yaoo_1

木虫 (小有名气)

[求助] 关于建模结构优化的一些问题

新手發問
请问一下我想做有特定形状的缺陷的2x2x2的 周期性 的结构,材料是使用硅,要计算态密度,声子谱,能带结构

有试着先做一个的3x3x3超晶胞10颗缺陷的结构,在CPU i5- 2400 内存为8G的电脑上面跑不过跑了一天的工作就失败了,看来电脑不够力

结构优化第一次点选ultralfine,180 eV的k点4x4x4所做出来的晶格常数为5.39
更改不同的截止能量后要看能量收敛的程度
看到文献都会用 截止能量 跟 能量 的关系
那么是要看 final energy 吗还是迭代之后的 total energy 呢
有试着用硅晶胞边常设为5.4309然后用原始晶胞去最佳化分别选用LDA跟GGA- PBE的截止能量各从100~1000 k点的1x1x1 赝势为ultrasoft 其他都是预设值,晶体越大所需k点数越少
看到一些教学提到硅材料截止能量不需要太高大概在200 eV的的截止能量就能得到准确的数值?
而得出的总能量我是看最后一次出现的final energy
而总能量LDA的大约都在-102.xx eV的左右GGA大约在-102.90xx
LDA的会低估晶格常数GGA会高估晶格常数



回归正题想问一下必须先用优化过后的结构去建立的2x2x2的超晶胞
再删除我想要的原子数,(還是說必须要有真空层吗,看到教学文件指出非周期性的的分子或晶体才需要使用真空层预防波函数重叠),再进行一次结构最佳化计算我要的物性,選用的截止能量跟k-point都是沿用这样对吗?

题外话,另外想问一下因为大概是一百颗原子,以现在的Core i7 3.4 GHz的四核8线的电脑大概需要多少时间有哪位高手知道吗

希望大家一起交流指教,谢谢

[ Last edited by yaoo_1 on 2011-9-9 at 01:01 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

MaterialStudio学习使用 第一性原理 杂七杂八

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yaoo_1

木虫 (小有名气)

???????:
8?: Originally posted by 52nana at 2011-09-10 20:12:26:
????????????????????????????
?????????????????????????3*3??2*2???????????????????????????????????о??????????λ????????????????
???磺???????????100????????λ????0. ...

лл???????????Щ?????????????????
????????????????????????????????????????????????
??????????????ε????е????
http://dl.dbank.com/c02mrce2g2
?????λ?? ????????

?????????????
9楼2011-09-12 11:16:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
yaoo_1(金币+1): 感谢版主的指导 2011-09-09 11:45:01
gzqdyouxia(金币+2): 谢谢指教 2011-09-09 16:12:30
说一下你的设置:ultralfine,180 eV的k点4x4x4所做出来的晶格常数为5.39
这里很不和谐!ultralfine,180 eV这两个更是了,180太低了
你的总能与计算的这个截断能不一样,注意概念,这两个没啥大直接的关系。
一般优化分几步进行,
首先进行一次粗糙的优化,用mid就行,大概300ev,k点可以少一点
然后进行第二步,选择fine 450eV 4x4x4,也就差不多了
一步优化对于粗糙的结构很难收敛
嘟啦啦嘟啦啦嘟
2楼2011-09-09 10:09:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yaoo_1

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 贺仪 at 2011-09-09 10:09:15:
说一下你的设置:ultralfine,180 eV的k点4x4x4所做出来的晶格常数为5.39
这里很不和谐!ultralfine,180 eV这两个更是了,180太低了
你的总能与计算的这个截断能不一样,注意概念,这两个没啥大直接的关系。
...

版主抱歉我看错加上打错了
3x3x3 是另外一部份

结构最佳化第一次点选ultralfine,180 EV的k点4x4x4所做出来的晶格常数为5.39
这部分我是想说先练习用的
读入硅之后再变成单胞做测试ultralfine,180 EV的 k点1x1x1 赝势为ultrasoft
昨晚  思绪不太清晰 有点手足无措 卡关很久了
3楼2011-09-09 11:13:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yaoo_1

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by yaoo_1 at 2011-09-09 11:13:53:
版主抱歉我看错加上打错了
3x3x3 是另外一部份

结构最佳化第一次点选ultralfine,180 EV的k点4x4x4所做出来的晶格常数为5.39
这部分我是想说先练习用的
读入硅之后再变成单胞做测试ultralfine,180 EV的  ...

漏掉一些讯息
有看一些文献写说截止能量在多少时总能跟晶格常数会有最佳收敛的效果
类似像这样


我要做的模型是中心去掉一颗及五颗原子的模型


昨天有看到一些讨论串说
超晶胞是对原胞的扩展,比如3*3,2*2等,扩展而成新的重复单元。超晶胞一般用于研究缺陷,比如空位浓度,或者掺杂原子等。
例如:如果你的晶胞有100个原子,空位浓度为0.01,那么就要把晶胞扩展10倍,然后,从supercell里面去除一个原子。这样的空位浓度才等于0.01
那我一开始模型就建错了吗
学习了看了一些教学好像没提到版主说的要两次优化
4楼2011-09-09 11:34:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿苏州大学材料工程(085601)专硕有科研经历三项国奖两个实用型专利一项省级立项 +3 大火山小火山 2026-03-16 5/250 2026-03-16 16:54 by barlinike
[考研] 本人考085602 化学工程 专硕 +12 不知道叫什么! 2026-03-15 14/700 2026-03-16 16:45 by 我的船我的海
[考研] 318求调剂 +3 Yanyali 2026-03-15 3/150 2026-03-16 16:41 by houyaoxu
[考研] 304求调剂 +3 曼殊2266 2026-03-14 3/150 2026-03-16 16:39 by houyaoxu
[考研] 308求调剂 +3 是Lupa啊 2026-03-16 3/150 2026-03-16 10:07 by 求调剂zz
[硕博家园] 深圳大学硕士招生(2026秋,传感器方向,仅录取第一志愿) +4 xujiaoszu 2026-03-11 8/400 2026-03-16 09:45 by xujiaoszu
[考研] 327求调剂 +6 拾光任染 2026-03-15 11/550 2026-03-15 22:47 by 拾光任染
[考研] 070305求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-14 4/200 2026-03-15 11:04 by peike
[考研] 331求调剂(0703有机化学 +5 ZY-05 2026-03-13 6/300 2026-03-14 10:51 by Jy?
[考研] 330求调剂 +3 ?酱给调剂跪了 2026-03-13 3/150 2026-03-14 10:13 by JourneyLucky
[考研] 一志愿湖师大化学289求调剂 +6 XMCMM3.14159 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:28 by JourneyLucky
[考研] 318求调剂 +3 李新光 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:21 by JourneyLucky
[考研] 26调剂/材料/英一数二/总分289/已过A区线 +6 步川酷紫123 2026-03-13 6/300 2026-03-13 21:59 by 星空星月
[考研] 281求调剂 +9 Koxui 2026-03-12 11/550 2026-03-13 20:50 by Koxui
[考研] 290求调剂 +7 ADT 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:17 by JourneyLucky
[考研] 土木第一志愿276求调剂,科研和技能十分丰富,求新兴方向的导师收留 +3 土木小天才 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:01 by JourneyLucky
[考研] 289求调剂 +3 李政莹 2026-03-12 3/150 2026-03-13 11:02 by 求调剂zz
[考研] 296求调剂 +3 大口吃饭 身体健 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:31 by 学员8dgXkO
[基金申请] 提交后的基金本子,已让学校撤回了,可否换口子提交 +3 dut_pfx 2026-03-10 3/150 2026-03-11 08:38 by kudofaye
[考博] 26申博求助 +3 跳跃饼干 2026-03-10 4/200 2026-03-10 21:15 by Tntcnn
信息提示
请填处理意见