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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » openmpi安装错误
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haowenping

木虫 (著名写手)

[求助] openmpi安装错误

如题，在安装vasp的时候，安装openmpi-1.2.6，
$./configure --prefix=/opt/openmpi FC=/opt/intel/bin/ifort F90=/opt/intel/bin/ifort
出现如下错误：
checking for a BSD-compatible install... /usr/bin/install -c
checking whether build environment is sane... configure: error: newly created file is older than distributed files!
Check your system clock
以前用同样的方法在单机上成功编译过vasp，但是现在在集群上安装出现如上问题，让人郁闷与纠结，希望虫友能帮忙一下。不甚感激，单机安装通过了，并行安装时候，出现如上问题，期待中~
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1楼2011-09-07 21:28:11
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haowenping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 贺仪 at 2011-09-07 22:54:40:
newly created file is older than distributed files!
是不是你的系统里面已经有openmpi了？而且还在路径里面？
或者就是你的编译软件（ifort）修改的日期比你现在的日期还要晚

你可以试着去掉
FC=/opt/in ...

谢谢你的回答，我试了一下你刚说的方法，问题依旧那样。还有因为这个节点我刚刚用，我也具体不知道是否有openmpi，那么，我用什么命令可以查看该节点下面是否有openmpi？如果有openmpi，我又该用什么办法知道他安装的路径呢？希望高手继续帮忙，不甚感激~
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3楼2011-09-08 08:06:45
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haowenping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 贺仪 at 2011-09-07 22:54:40:
newly created file is older than distributed files!
是不是你的系统里面已经有openmpi了？而且还在路径里面？
或者就是你的编译软件（ifort）修改的日期比你现在的日期还要晚

你可以试着去掉
FC=/opt/in ...

刚才还没有完全认真的看懂你的回帖，你说的把我的我的
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4楼2011-09-08 08:09:17
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haowenping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 贺仪 at 2011-09-07 22:54:40:
newly created file is older than distributed files!
是不是你的系统里面已经有openmpi了？而且还在路径里面？
或者就是你的编译软件（ifort）修改的日期比你现在的日期还要晚

你可以试着去掉
FC=/opt/in ...

你说的“把有的fortran编译器放入路径里面就可以了直接这样就行了”，这个是什么意思呢？我该把哪些东西放到我的这个安装路径下面？我的ifort安装在
/intel/composerxe-2011.4.191/bin/intel64/ifort
我只需要把ifort放入到/opt/openmpi下面就行了吗？
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5楼2011-09-08 08:12:16
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haowenping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 贺仪 at 2011-09-07 22:54:40:
newly created file is older than distributed files!
是不是你的系统里面已经有openmpi了？而且还在路径里面？
或者就是你的编译软件（ifort）修改的日期比你现在的日期还要晚

你可以试着去掉
FC=/opt/in ...

你好，我把/intel/composerxe-2011.4.191/bin/intel64/ifort
复制到 /opt/openmpi 下面然后./configure --prefix=/opt/openmpi仍然是出现一样的问题希望虫友帮帮忙。
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6楼2011-09-08 08:18:10
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haowenping

木虫 (著名写手)
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7楼: Originally posted by 贺仪 at 2011-09-08 08:30:38:
放入路劲临时的可以这样 export PATH=$PATH:/intel/composerxe-2011.4.191/bin/intel64(这就是你的ifort所在的目录)

你的这个问题好像是你的系统时间不正确导致的，如果你有root权限你可以把时间修改正确，再安 ...

谢谢你的回答，我的这个是一个小节点，没有root权限，时间是改不了的，我昨天晚上试一试。但是问题依然是那样的，郁闷。你可知道我这个系统里面是否有openmpi？怎么查看他的路径？还有我在这个节点下面输入mpd &显示正常，也就是说，其实openmpi，或者mpich等已经装上了，但是我装vasp并行的时候，无法指定这些路径，不知道如何弄。
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8楼2011-09-08 08:38:40
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haowenping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 贺仪 at 2011-09-08 09:33:02:
echo $PATH,可以查看你的环境变量
既然这个运行mpd  那么你就用which mpd，这样会提示给出mpd所在的目录

非常感谢，我试一试，有问题再联系你。
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10楼2011-09-08 20:00:49
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haowenping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 贺仪 at 2011-09-08 09:33:02:
echo $PATH,可以查看你的环境变量
既然这个运行mpd  那么你就用which mpd，这样会提示给出mpd所在的目录

$which mpd
显示的是：~/intel/composerxe-2011.4.191/mpirt/bin/intel64/mpd
这个intel编译器是我编译的，但是怎么mpd在它的下面呢？我的问题在哪里？
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11楼2011-09-08 20:04:48
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haowenping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 贺仪 at 2011-09-07 22:54:40:
newly created file is older than distributed files!
是不是你的系统里面已经有openmpi了？而且还在路径里面？
或者就是你的编译软件（ifort）修改的日期比你现在的日期还要晚

你可以试着去掉
FC=/opt/in ...

谢谢版主，为什么我的帖子总是没有人回答呢？只有版主帮我啊，我的时钟应该是有问题的，但是我没有root用户，我怎么能修改时间呢？我该如何装上呢？希望大家帮帮忙啊。
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12楼2011-09-14 08:44:44
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haowenping

木虫 (著名写手)
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13楼: Originally posted by 贺仪 at 2011-09-14 09:04:35:
只能帮到这里了 ，具体问题还得具体来弄，多试试几次吧，出了问题google上去搜

谢谢啊，只是，基本上都说是系统时间引起的，但是我$date后，系统时间居然跟现在的时间是差不多的，而且，如果我要修改时间，也没有root用户，
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14楼2011-09-14 09:25:16
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