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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » ssr标记与srap标记可以用同一种酶吗？
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qidannvzi

银虫 (正式写手)

[交流] ssr标记与srap标记可以用同一种酶吗？

跑srap总是出不来，想换种酶，现在用的是酶，碱基，镁离子，buffer混在一起的，有条带，但是不理想，想换种酶，不知可行否，有做过的吗，你们用的是什么样的酶呢？
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1楼 2011-09-07 14:43:52
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wanhscn

木虫 (职业作家)
★ ★ ★
qidannvzi(金币+1):谢谢参与
dhd997(金币+2): 很活跃，很热心的版版 2011-09-08 07:40:49
qidannvzi(金币+5): 2011-09-09 07:22:26
跟酶没有关系。SRAP是RAPD的升级版，重复性比RAPD好，用PAGE跑，有的引物组合比较难扩。你的扩增程序怎么样。有没有在冰上混体系，加反应液？
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2楼2011-09-07 17:11:16
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瓶儿花

金虫 (小有名气)
★
qidannvzi(金币+1):谢谢参与
是的，跟酶没有多大关系的。
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3楼2011-09-07 17:32:35
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leimiao_hit

木虫之王 (文学泰斗)
★
qidannvzi(金币+1):谢谢参与
跟酶没有多大关系
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5楼2011-09-07 18:15:31
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lxzhq

铁杆木虫 (著名写手)
★
qidannvzi(金币+1):谢谢参与
跟酶没有多大关系
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6楼2011-09-07 18:58:43
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qidannvzi

银虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wanhscn at 2011-09-07 17:11:16:
跟酶没有关系。SRAP是RAPD的升级版，重复性比RAPD好，用PAGE跑，有的引物组合比较难扩。你的扩增程序怎么样。有没有在冰上混体系，加反应液？

点样的时候放在冰上，混体系的时候没有，这个影响大吗？
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12楼2011-09-09 07:23:42
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小小豆豆

金虫 (小有名气)
★
qidannvzi(金币+1):谢谢参与
你用的是哪个公司的酶，如果是一些小公司的产品的话，我建议你可以换一下试试，我原来做的时候，曾经用过国内一家公司的产品，效果极差，但是换了之后。反应体系没动，结果就有了。不过，在换酶之前，你最好确认一下，是否是酶的问题。
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13楼2011-09-09 10:06:12
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wanhscn

木虫 (职业作家)
引用回帖:
12楼: Originally posted by qidannvzi at 2011-09-09 07:23:42:
点样的时候放在冰上，混体系的时候没有，这个影响大吗？

一般影响不大，但遇到难扩的时，这个就上升为影响因素了！
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14楼2011-09-09 10:16:19
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qidannvzi

银虫 (正式写手)
引用回帖:
13楼: Originally posted by 小小豆豆 at 2011-09-09 10:06:12:
你用的是哪个公司的酶，如果是一些小公司的产品的话，我建议你可以换一下试试，我原来做的时候，曾经用过国内一家公司的产品，效果极差，但是换了之后。反应体系没动，结果就有了。不过，在换酶之前，你最好确认一 ...

北京鼎国的，还行吧，之前都用的这个！
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15楼2011-09-09 10:16:52
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小小豆豆

金虫 (小有名气)
做过体系的优化吗，各成分是否做过单因素或正交试验，来确定最佳体系。
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16楼2011-09-09 10:21:13
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wanhscn

木虫 (职业作家)
引用回帖:
16楼: Originally posted by 小小豆豆 at 2011-09-09 10:21:13:
做过体系的优化吗，各成分是否做过单因素或正交试验，来确定最佳体系。

SRAP是遗传标记，一般这个程序是现成的，引物也是通用的，别人已经优化好了@
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17楼2011-09-09 10:26:28
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小小豆豆

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
qidannvzi(金币+1): 2011-09-10 13:08:06
wanhscn(金币+3): 鼓励互动交流！ 2011-09-12 14:50:35
那就是说，你用的是资料上提供的PCR程序了，并没有做体系的优化是吧。这样不行，因为你所用的试剂，设备等都与资料上的不同，所以不能保证你可以利用原程序重复得到此结果，我原来在做srap pcr时，第一学期采用优化后的程序效果不错，但下学期因为跟换酶，原体系就得不到结果了，所以又做了一次单因素试验来确定最佳体系。
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18楼2011-09-09 10:36:29
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wanhscn

木虫 (职业作家)
引用回帖:
13楼: Originally posted by 小小豆豆 at 2011-09-09 10:06:12:
你用的是哪个公司的酶，如果是一些小公司的产品的话，我建议你可以换一下试试，我原来做的时候，曾经用过国内一家公司的产品，效果极差，但是换了之后。反应体系没动，结果就有了。不过，在换酶之前，你最好确认一 ...

他是做标记的，做标记一般用最差的酶就可以了，我们实验室做标记Taq酶全是自己专门的人员提的。
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19楼2011-09-09 14:27:57
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liugs

禁虫 (正式写手)
★
qidannvzi(金币+1):谢谢参与
本帖内容被屏蔽
20楼2011-09-09 16:56:54
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bluysky0902

金虫 (正式写手)
★
qidannvzi(金币+1):谢谢参与
学习了~
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22楼2011-09-19 15:41:50
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魍魉人生

银虫 (小有名气)
★
qidannvzi(金币+1):谢谢参与
我想知道srap能不能用到动物上去，我看的都是植物上应用的比较多
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23楼2011-10-26 09:32:32
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jm0074楼
2011-09-07 17:58   回复  
qidannvzi(金币+1):谢谢参与
abczhang7楼
2011-09-07 19:13   回复  
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lxzhq8楼
2011-09-08 20:03   回复  
liuss8189楼
2011-09-08 20:15   回复  
qidannvzi(金币+1):谢谢参与
求阙人10楼
2011-09-08 20:28   回复  
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gxsun11楼
2011-09-08 20:52   回复  
qidannvzi(金币+1):谢谢参与
liuchenammk21楼
2011-09-12 13:54   回复  
qidannvzi(金币+1):谢谢参与
wanhscn(金币+3): 鼓励新虫多多回帖! 2011-09-13 08:05:30
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