24小时热门版块排行榜

返回列表

amo11000

金虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 2431.2
散金: 35
红花: 1
帖子: 257
在线: 292小时
虫号: 531672
注册: 2008-03-23
专业: 生物信息学

[求助] 谁能用VB帮忙设计一个查找序列中的串联重复软件？

谁能用VB帮忙设计一个查找序列中的串联重复软件？
具体情况是这样的：
有一序列是由字母A, B, C, D, E, F, G构成，总共由5千万个这样的字母构成：
ABCBEDDFFFFFFFFFFGACACACACACACACACACACACBGFDCDCDCDCDCDABCABCABCADEFADEFADEFADEFADEFADEFABCDEFGABCDEFGABCDEFG……
现在想开发一个工具，从中查找串联重复：串联重复顾名思义就是由一串相同的字符或片段构成，例如FFFFFFFFFF，是由10个相同的字母F构成，我们把10叫做重复单元的规模，F叫做重复的基序，基序的长度是1，这个串联重复的长度是10。又例如ACACACACACACACACACACAC是由11个相同的AC构成，重复单元的规模是11，基序是AC，基序的长度是2，这个串联重复的长度是22。ABCABCABC是由3个相同的ABC构成，重复单元的规模是3，基序是ABC，基序的长度是3，这个串联重复的长度是9。ABCDEFGABCDEFGABCDEFG是由三个相同的ABCDEFG构成，重复单元的规模是3，基序是ABCDEFG，基序的长度是6，这个串联重复的长度是18。
产生的数据要求被组织成这样的格式：
首先要报告这条序列的长度：5千万
然后逐渐显示查找到的各个串联重复：
基序基序的长度  重复单元的规模串联重复的长度
No.1 F       1             10             10
No.2  AC    2             11             22
No.3  ABC    3             3                9
……
谁能用VB帮忙设计一个这样的工具啊，万分感谢啊。

回复此楼