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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » Run-autodock步骤求助
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可米kemi

银虫 (小有名气)

[求助] Run-autodock步骤求助

学习autodock不久，也遇到很多问题，感觉有好几次是因为文件路径的原因。好不容易前面的几步弄差不多了，准备用Run-autodock步骤进行对接，又出问题了，情况如下图所示。
    想通过Browse按钮进行改变，结果根本找不到相应的dpf文件。所以，求高手相助。
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1楼 2011-08-31 20:02:00
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PSA

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-09-07 14:29:48
可米kemi(金币+1): 存了，在Output里面有直接显示是dpf格式的。不过还是谢谢哦。 2011-09-08 09:24:32
可米kemi(金币+5): 谢谢，的确如此。 2011-09-14 08:46:57
我猜是你保存时没存成4321.dpf的格式
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2楼2011-09-06 16:20:10
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绿茶QJM

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-09-08 14:35:26
可米kemi(金币+4): 谢谢。 2011-09-14 08:47:06
你在保存DPF文件时，在文件名后，加上DPF后缀，再保存，试试能不能找到。如果是WIN版的AUTODOCK，路径很需要注意。如果是LINUX版的，就不清楚了
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3楼2011-09-08 11:36:10
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gouyi

金虫 (正式写手)

sanchuanok
问一下，我在在分子显示窗口中分别点击两个残基上CA和CB原子之间的键，使之变成非扭转的，怎么选不中
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生命不止，奋斗不息；天赋人责，舍我其谁！
4楼2011-10-24 15:28:44
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可米kemi

银虫 (小有名气)
不好意思，这个我也不会啊。
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5楼2011-10-26 15:31:58
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先寇布中将

金虫 (初入文坛)
★
ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-10-31 13:40:14
保存的时候要自己加.dpf，不加就没后缀
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6楼2011-10-31 10:19:21
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shuifen1108

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by gouyi at 2011-10-24 15:28:44:
问一下，我在在分子显示窗口中分别点击两个残基上CA和CB原子之间的键，使之变成非扭转的，怎么选不中

把它放大之后就比较好点了，你试一下
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7楼2011-10-31 14:41:50
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