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药用植物麦冬ITS序列的扩增?
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| 药用植物麦冬ITS序列的扩增,请高手指点一下,我扩了一两个月都没能稳定的扩出来。ITS序列的扩增引物分别为位于18S上ITS5(5-GGAAGTAAAAGTCGTAACAAGG-3)和位于26S上的ITS4(5-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3)。PCR反应体系25μL总体积中,含有10×PCR buffer (上海生工)2.5μL;25mmol/L MgCl2 (上海生工)1.5μL;10 mmol/L dNTP mixture(上海生工) 0.5μL;10μmol/L引物各1.5μL;5 U/μL Taq DNA酶(上海生工)0.3μL;DNA模板3.0μL(约100ng)。扩增反应程序:95℃预变性4 min,95℃变性50 sec,50℃退火50 sec,72℃延伸90 sec,共35个循环,72℃延伸7 min,4℃保温。在那方面可能有问题呢?需做如何改进。谢谢。。凝胶电泳图见附件。 |
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jb1003(金币+1):谢谢参与
dhd997(金币+3): good 2011-08-31 17:06:25
jb1003(金币+1):谢谢参与
dhd997(金币+3): good 2011-08-31 17:06:25
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我做的PCR反应体系是这样的,你可以参考一下:50μL反应体系 10×PCR Buffer 5μL Mgcl2 3μL dNTPs 4μL 10μmol/L引物 各0.5μL 5U/μL rTaq 0.5μL DNA模板 0.5μL PCR扩增反应程序: 95℃预变性3min; 95℃变性1min; 55℃退火1min; 72℃延伸90s;30个循环; 72℃延伸8min,4℃保存。 根据你的反应体系来看,可能是DNA模板浓度太高,适当把模板浓度降低一点,我曾经也是这样,高浓度模板是P不出来的,后来稀释了50倍,电泳检测条带是很亮的。你可以试试看。另外,循环次数过多非特性会增多的,退火温度太低,非特异性也就多了。 |
2楼2011-08-31 14:33:38














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