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zml2009木虫 (正式写手)
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g09提交不了作业
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| 我在服务器上自己的用户名下提交作业，以前一直都可以用G09提交，最近服务器关闭了一段时间重启后我提交作业用G03可以，G09反而不行，请问这是怎么回事？谢谢高手指点！ |
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2楼2011-08-29 20:19:52
zml2009
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Initial command: /opt/gauss/g03/l1.exe /scratch/Gau-6026.inp -scrdir=/scratch/ Entering Link 1 = /opt/gauss/g03/l1.exe PID= 6027. Copyright (c) 1988,1990,1992,1993,1995,1998,2003,2004, Gaussian, Inc. All Rights Reserved. This is the Gaussian(R) 03 program. It is based on the the Gaussian(R) 98 system (copyright 1998, Gaussian, Inc.), the Gaussian(R) 94 system (copyright 1995, Gaussian, Inc.), the Gaussian 92(TM) system (copyright 1992, Gaussian, Inc.), the Gaussian 90(TM) system (copyright 1990, Gaussian, Inc.), the Gaussian 88(TM) system (copyright 1988, Gaussian, Inc.), the Gaussian 86(TM) system (copyright 1986, Carnegie Mellon University), and the Gaussian 82(TM) system (copyright 1983, Carnegie Mellon University). Gaussian is a federally registered trademark of Gaussian, Inc. This software contains proprietary and confidential information, including trade secrets, belonging to Gaussian, Inc. This software is provided under written license and may be used, copied, transmitted, or stored only in accord with that written license. The following legend is applicable only to US Government contracts under FAR: RESTRICTED RIGHTS LEGEND Use, reproduction and disclosure by the US Government is subject to restrictions as set forth in subparagraphs (a) and (c) of the Commercial Computer Software - Restricted Rights clause in FAR 52.227-19. Gaussian, Inc. "4x5-t-hse.log" 96L, 4381C 1,2 Top Gaussian 03, Revision D.01, M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, J. A. Montgomery, Jr., T. Vreven, K. N. Kudin, J. C. Burant, J. M. Millam, S. S. Iyengar, J. Tomasi, V. Barone, B. Mennucci, M. Cossi, G. Scalmani, N. Rega, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, M. Klene, X. Li, J. E. Knox, H. P. Hratchian, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, P. Y. Ayala, K. Morokuma, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, V. G. Zakrzewski, S. Dapprich, A. D. Daniels, M. C. Strain, O. Farkas, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, Q. Cui, A. G. Baboul, S. Clifford, J. Cioslowski, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, C. Gonzalez, and J. A. Pople, Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2004. ****************************************** Gaussian 03: AM64L-G03RevD.01 13-Oct-2005 29-Aug-2011 ****************************************** %chk=/home/guoyong3/graphse/ct/4x5-t-hse.chk %mem=3000mb %nproc=8 Will use up to 8 processors via shared memory. ---------------------------------- # opt=noeigen uhseh1pbe/6-31g(d,p) ---------------------------------- QPERR --- A SYNTAX ERROR WAS DETECTED IN THE INPUT LINE. # opt=noeigen uhseh1pbe/6-31g(d,p) ' Last state="GCL" TCursr= 909 LCursr= 14 Error termination via Lnk1e in /opt/gauss/g03/l1.exe at Mon Aug 29 17:12:38 2011. Job cpu time: 0 days 0 hours 0 minutes 5.4 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 8 Int= 0 D2E= 0 Chk= 1 Scr= 1 这就是用不到G09，而是用G03来计算，G03算不了HSE，所以提示错误，我使用G09提交的，如前所述，以前都可以用G09算的，服务器重启后有好多节点都关闭了，只开了出部分几个来供大家计算，现在用G03可以算，G09反而不行 |
3楼2011-08-29 20:31:08
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【答案】应助回帖
zml2009(金币+2): 2011-08-30 08:44:20
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很明显是调用G03算的，而不是G09，查看一下调用的G09是否存在， [afea@console Ion]$ which g09 ~/soft/gauss/g09/g09 如果是g09 xx.com&提交 看看.bashrc（假设你是用的bshell）是不是g09 export g09root=~/soft/gauss . $g09root/g09/bsd/g09.profile 如果同时有G03和G09的定义，封上g03的（句前加#），否则有可能会是g03 脚本pbs，或者sge脚本提交，似乎不该出现这样问题！ |
4楼2011-08-29 21:05:06
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