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ms中导入含几个氨基酸残基的文件，用discover做minimization出错
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下面是输出文件，貌似是说立场参数找不到，我应该怎么添加立场参数啊，在哪里添加呢？ --------------------------------------------------------------- Checked out license feature: MS_discover_MP --------------------------------------------------------------- randomSeed is set to 653317 Line 7:BTCL> autoEcho off --------------------------------------------------------------- Checked out license feature: MS_compass_MP --------------------------------------------------------------- INPUT FILES ___________ File Type Name --------- ---- Forcefield /home/xmpu208/Accelrys/MaterialsStudio50/etc/Gateway/../../share/Discover/res/compass.frc Molecular data 559_412_516.mdf Coordinate 559_412_516.car Error: Energy expression: cannot find parameters for bond: C(c)-O(o1-) Error: Energy expression: cannot find parameters for bond: C(c)-O(o1-) Error: Energy expression: cannot find parameters for bond: CD(c)-OE1(o1-) Error: Energy expression: cannot find parameters for bond: CD(c)-OE2(o1-) Error: Energy expression: cannot find parameters for bond: C(c)-O(o1-) invoked from within "minimize \ method = newton \ iteration_limit = 5000 \ sd \ convergence = 1000.0000000 \ line_search_precision ..." Total time used by DISCOVER: 0.09 secs Completion date: Thu Aug 18 15:41:57 2011 Exiting Discover: An ERROR has occurred! |
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