| 查看: 1298 | 回复: 4 | ||
[求助]
ms中导入含几个氨基酸残基的文件，用discover做minimization出错
|
|
下面是输出文件，貌似是说立场参数找不到，我应该怎么添加立场参数啊，在哪里添加呢？ --------------------------------------------------------------- Checked out license feature: MS_discover_MP --------------------------------------------------------------- randomSeed is set to 653317 Line 7:BTCL> autoEcho off --------------------------------------------------------------- Checked out license feature: MS_compass_MP --------------------------------------------------------------- INPUT FILES ___________ File Type Name --------- ---- Forcefield /home/xmpu208/Accelrys/MaterialsStudio50/etc/Gateway/../../share/Discover/res/compass.frc Molecular data 559_412_516.mdf Coordinate 559_412_516.car Error: Energy expression: cannot find parameters for bond: C(c)-O(o1-) Error: Energy expression: cannot find parameters for bond: C(c)-O(o1-) Error: Energy expression: cannot find parameters for bond: CD(c)-OE1(o1-) Error: Energy expression: cannot find parameters for bond: CD(c)-OE2(o1-) Error: Energy expression: cannot find parameters for bond: C(c)-O(o1-) invoked from within "minimize \ method = newton \ iteration_limit = 5000 \ sd \ convergence = 1000.0000000 \ line_search_precision ..." Total time used by DISCOVER: 0.09 secs Completion date: Thu Aug 18 15:41:57 2011 Exiting Discover: An ERROR has occurred! |
回复此楼» 猜你喜欢
3-溴吡啶-4-甲醛合成
已经有9人回复
-
求调剂
已经有19人回复
-
材料专硕322
已经有6人回复
-
一志愿南京航空航天大学 材料与化工329分求调剂
已经有3人回复
-
285求调剂
已经有9人回复
-
材料求调剂
已经有11人回复
-
调剂
已经有8人回复
-
材料调剂
已经有14人回复
-
材料334求调剂
已经有17人回复
-
332求调剂
已经有16人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 求助MS中怎么修改晶格矢量的直角坐标
已经有10人回复
- β-氨基酸在BTC的作用下会成环后处理方法讨论
已经有4人回复
- 维普文献导入到endnote x4中的问题
已经有4人回复
- 重组蛋白前面会不会有其他的氨基酸残基
已经有11人回复
- 请高手指点批量选择不同文件的方法
已经有7人回复
- 蛋白质氮 和 氨基酸氮 是一回事吗？两个是相等的吗，在同一溶液中。
已经有5人回复
- 第一次word打开总是出错
已经有5人回复
- 在把U盘变成启动盘时出错，U盘可识别但无法打开怎么办？
已经有6人回复
- 【XRD求助】同样的PDF卡，不同文件里显示的出峰位置不一样
已经有3人回复
- noteexpress导入pubmed检索题录结果时，作者机构变成了作者地址的问题
已经有4人回复
- 下载的PSP游戏应该放在哪个文件夹里?
已经有2人回复
- 移动硬盘内文件夹无法显示
已经有14人回复
wzbhit
至尊木虫 (著名写手)
- 应助: 84 (初中生)
- 金币: 11959.7
- 散金: 26
- 红花: 36
- 帖子: 1162
- 在线: 256.7小时
- 虫号: 1128043
- 注册: 2010-10-21
- 专业: 理论和计算化学
2楼2011-08-18 18:26:36
3楼2011-08-18 20:47:26
wzbhit
至尊木虫 (著名写手)
- 应助: 84 (初中生)
- 金币: 11959.7
- 散金: 26
- 红花: 36
- 帖子: 1162
- 在线: 256.7小时
- 虫号: 1128043
- 注册: 2010-10-21
- 专业: 理论和计算化学
4楼2011-08-18 23:31:05
youzhizhe: 祝你好运。 2011-08-19 16:40:10
|
第一，我自己画的一个甲烷分子可以用discover模块进行minimization，而且默认的也应该是COMPASS力场，可以算，结果正确。第二，我也换力场，但是在进行minimization计算时候没有涉及到选择力场的问题，也不知道在哪里换啊，而且我想试一下setup计算（因为里面可以换力场），却保存不了，具体情况在我的下一个求助帖子：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3498694，唉，这些问题真是难倒我了，身边就我一个人在用这个软件，目前是前无古人，不知道后有无来着呢！！希望多指教了 |
5楼2011-08-19 08:45:27
