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[资源] cif2pos的更新版本生成的POSCAR和cell文件的结果一致

原版地址:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2189189&fpage=0&view=&highlight=&page=1
感谢hedaors

只要更新晶格常数部分。使生成的POSCAR和cell文件的结果一致。
欢迎大家提出宝贵意见。
测试六角晶系没有问题,和cell文件保持一致。
欢迎大家给出其他晶系的测试结果。谢谢。

PS:本修改的目的只是给出另一种方法。非喜勿下。
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用MS输出的时候要把所有的Bond删除了,而且要make P1。
python要用2.6版的不能太老也不能太新。
2楼2011-08-13 06:01:52
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★★★★★ 五星级,优秀推荐

呵呵
3楼2011-08-13 16:30:50
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liangpei

木虫 (职业作家)


★★★ 三星级,支持鼓励

引用回帖:
2楼: Originally posted by wuli8 at 2011-08-13 06:01:52:
用MS输出的时候要把所有的Bond删除了,而且要make P1。
python要用2.6版的不能太老也不能太新。

哥们,这个还是需要继续努力修正的吧,似乎还有问题啊
4楼2011-08-15 14:43:07
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引用回帖:
4楼: Originally posted by liangpei at 2011-08-15 14:43:07:
哥们,这个还是需要继续努力修正的吧,似乎还有问题啊

具体什么问题?
我的六角结构和cell文件的一样。
5楼2011-08-15 15:44:03
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enola

捐助贵宾 (正式写手)


★★★ 三星级,支持鼓励

谢谢斑竹
6楼2011-08-15 16:42:53
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liangpei

木虫 (职业作家)


引用回帖:
5楼: Originally posted by wuli8 at 2011-08-15 15:44:03:
具体什么问题?
我的六角结构和cell文件的一样。

这个似乎还没有按照原子来排序吧
7楼2011-08-16 09:47:29
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引用回帖:
7楼: Originally posted by liangpei at 2011-08-16 09:47:29:
这个似乎还没有按照原子来排序吧

原子次序是自己输入定义的。
我重新确认了一下和cell文件的坐标是完全一致的
8楼2011-08-16 13:44:44
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liangpei

木虫 (职业作家)


引用回帖:
8楼: Originally posted by wuli8 at 2011-08-16 13:44:44:
原子次序是自己输入定义的。
我重新确认了一下和cell文件的坐标是完全一致的

我check一下,谢谢!
9楼2011-08-19 09:56:31
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liangpei

木虫 (职业作家)


怎么运行啊!???
10楼2011-10-16 20:41:36
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引用回帖:
1474403楼: Originally posted by liangpei at 2011-10-16 20:41:36
怎么运行啊!???

这是一个用 python 写的脚本,主要是将 cif 文件转成 vasp 用的  POSCAR, 目前只能用于转换 make p1 的 cif 文件,我般是用 materials studio 建完模之后,make p1 一

下,然后导出 cif 文件,然后再用 cif2pos 脚本转成 POSCAR
注意:要删除所有的键。
用法:

cif2pos 一共有两个参数, cif file,  title 。
其中 cif file 就是要转换的 cif 文件, title 是可选参数,可以不写,指的是 POSCAR 的第一行的标题。

cif2pos example.cif  CaCO3
或者直接

cif2pos example.cif

这时的 POSCAR 第一行就默认是 Title

程序会提示输入元素的名称,这个要和你的 POTCAR 顺序一致。
比如我的 POTCAR 顺序为 C O Ca (我习惯按元素序号的顺序)

就在程序提示时输入  C O Ca 回车,注意这里区分大小写。

输出在 POSCAR 里,同时屏幕打印出结果。
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2189189
14楼2013-01-12 12:50:47
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sungjen

银虫 (著名写手)


★★★ 三星级,支持鼓励

楼主能不能上传一份  python,还有就是怎么验证自己转换的是否正确,十分感激
15楼2013-07-12 10:19:26
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sungjen

银虫 (著名写手)


能不能告知下如何找到隐藏的cell文件,我的CASTEP文件夹下只有三个文件,没有找到cell文件啊
16楼2013-07-12 15:34:16
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天妖祸世

新虫 (初入文坛)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

好东西呀,老是搞不定cif到poscar这一步
19楼2013-12-23 19:35:38
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LIBAOLI44

新虫 (初入文坛)


★★★ 三星级,支持鼓励

谢谢楼主
27楼2016-10-08 18:29:09
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qqpie11楼
2011-12-19 17:44   回复  
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hy198700712楼
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victemww17楼
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cjcorange18楼
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redzou22楼
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netimes23楼
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