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bxguang130

金虫 (小有名气)

[求助] 以靶酶结合腔设计并合成的小分子抑制剂,细胞水平活性很好,但该酶水平上很差,疑问

以靶酶结合腔设计并合成的小分子抑制剂,细胞水平活性很好,但酶水平上很差,疑问
设计并合成了一类小分子酶抑制剂,并做了DS,模拟结果还可以,现在该类化合物对多个肿瘤细胞系抑制效果都还不错,1微摩左右吧,但对多个该类激酶在酶水平上的抑制活性比较差,10微摩以上,推测也许作用了其他信号传导途径或未知靶酶。
请问熟悉分子模拟的朋友们,怎样能从少数的活性好的小分子化合物出发,找寻与之能选择性结合的靶酶?有没有已知的酶库进行化合物识别对接的手段或方法?若有,国内哪儿有?
相信做药化的朋友可能会经常碰到类似问题,希望大家踊跃发言,谢谢啦!

[ Last edited by ghcacj on 2011-8-12 at 10:35 ]
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blue_cat

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
zh1987hs(金币+3): 谢谢 2011-09-04 15:06:03
给你提供几种方法进行参考
1、用反向对接,将与肿瘤相关的靶标下载下来,做一个反向对接,寻找可能的靶标;
2、做反向药效团筛选;
3、桑迪亚有一个老师叫杨家安,他开发的一套软件可以从活性化合物出发,来寻找与其结合的可能的靶标。
DS
7楼2011-09-03 13:21:19
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