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feiye2214

木虫 (正式写手)

[求助] 向genbank提交序列之后,收到一信件,需要提供有关样品的信息?有人遇到过么?救赎


小弟前天向genbank提交了一个cDNA全序列,今天收到回信,需要再提供一些信息,我第一次提交序列,各位大侠帮忙看看,到底是要什么东西?
难道是:样品采集的地点,采集方式?获得cDNA的方式和方法?跑胶照片?
求救赎!下面是信件的内容,照片也是
Dear GenBank Submitter:

Please find your assigned Accession Number(s) in the letter below.

Please provide a strain, isolate, clone, specimen voucher, OR an
alpha-numeric code used in your laboratory to distinguish your
submission(s) from others in the database. Note we are requesting
that you provide only one of these identifiers, if available.

For more information, please see:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK53701/

Send this information to: gb-admin@ncbi.nlm.nih.gov

Thank you and we look forward to hearing from you soon.

Sincerely,

The GenBank Submissions Staff
Bethesda, Maryland USA
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xiying8009

新虫 (小有名气)

LZ你好~我在提交序列的时候出现了一些问题,想向你请教一下。我提交的是昆虫的线粒体DNA中COI基因的部分序列,要求填写编码区。但在编码区翻译后的序列中总是有*号出现,不知道是什么原因?这种情况能否提交成功呢?!
7楼2012-02-18 19:27:40
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xiying8009

新虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by feiye2214 at 2012-02-18 20:02:30:
“编码区翻译后的序列中总是有*号出现”说明你的序列翻译之后中间出现了终止密码子,你的编码序列需要重新核对
你用MEGA重新校对一下,一般是编码最后才会出现*号的,是不是把内含子的起始和结尾弄错了?

恩,是呀,我的序列中出现了好多呢!我再校对一下看看,谢谢啦
9楼2012-02-18 23:09:25
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xiying8009

新虫 (小有名气)

楼主,我又核对了一遍序列,方向和起始啥的都没有问题。
而且线粒体COI基因按理说应该全是编码区。
我把blast出来的近缘序列放在MEGA里边校对,也出现了好多*,但是这些序列在NCBI里边的CDS区域都翻译的好好呀!这是怎么个原因呢?
10楼2012-02-21 15:38:04
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