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liuyusuc

禁虫 (正式写手)

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1楼 2011-08-03 17:55:48

已阅关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

fcenf

木虫 (初入文坛)

模拟EPI: 1
应助: 0 (幼儿园)
金币: 3032.2
红花: 1
帖子: 29
在线: 93.7小时
虫号: 740553
注册: 2009-04-05
性别: GG
专业: 理论和计算化学

★ ★ ★
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-08-15 09:21:03

引用回帖:

3楼: Originally posted by liuyusuc at 2011-08-13 17:40:28:
感谢您的指导，那么我所输入的内容会对结果有影响吗，如果有的话，又会是怎样的影响呢？另外，还想请教一下您的是，您是从哪里学到的有关tinker的这些知识的，我现在杠杆开始接触这类东西还不是很明白，请您帮帮 ...

对于pdb文件我也不了解，不清楚交替位点标识到底是干什么用的。但根据源码里写的，tinker会根据你的输入，在读取pdb文件时，忽略交替位点标识不为空格，并且和你的输入不同的坐标行，这应该对结果用影响吧～
学习tinker，一方面要对MD的基本知识有一定的了解，另外就是看官网上的手册呀。有能力的话可以看tinker的源码，还是很清晰的～