24小时热门版块排行榜    

查看: 681  |  回复: 3
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

liuyusuc

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuyusuc

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

3楼2011-08-13 17:40:28
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

fcenf

木虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
zh1987hs(金币+4): 谢谢 2011-08-13 08:46:59
liuyusuc(金币+2): 非常 感谢您的指导! 2011-08-13 17:36:36
引用回帖:
1楼: Originally posted by liuyusuc at 2011-08-03 17:55:48:
请教各位高手,Tinker程序中这句话的含义是什么  Enter a Set of Alternate Atom Locations  pdb.xyz

这个应该是让输入交替位点标识吧。交替位点标识是pdb文件坐标部分第17列的字符,你想用哪个交替位点标识,输入就行啦。如果pdb文件坐标部分第17列的字符和你输入的不同,并且也不是空格,那tinker就会忽略这行坐标的。
http://home.ustc.edu.cn/~fucf
2楼2011-08-12 11:58:49
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fcenf

木虫 (初入文坛)

★ ★ ★
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-08-15 09:21:03
引用回帖:
3楼: Originally posted by liuyusuc at 2011-08-13 17:40:28:
感谢您的指导,那么我所输入的内容会对结果有影响吗,如果有的话,又会是怎样的影响呢?另外,还想请教一下您的是,您是从哪里学到的有关tinker的这些知识的,我现在杠杆开始接触这类东西还不是很明白,请您帮帮 ...

对于pdb文件我也不了解,不清楚交替位点标识到底是干什么用的。但根据源码里写的,tinker会根据你的输入,在读取pdb文件时,忽略交替位点标识不为空格,并且和你的输入不同的坐标行,这应该对结果用影响吧~
学习tinker,一方面要对MD的基本知识有一定的了解,另外就是看官网上的手册呀。有能力的话可以看tinker的源码,还是很清晰的~
http://home.ustc.edu.cn/~fucf
4楼2011-08-14 11:08:52
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +12 医学老男孩 2026-08-13 30/1500 2026-08-14 06:02 by zyjwdhcs
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +3 启萌科技 2026-08-12 11/550 2026-08-13 22:57 by 启萌科技
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +9 Tide man 2026-08-10 10/500 2026-08-13 20:33 by 温淼淼淼
[硕博家园] 一作与独作在应聘高校教师时区别大吗 +3 mbygzh 2026-08-08 4/200 2026-08-13 19:31 by 龙-樱
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +22 Lanmanbaby 2026-08-09 36/1800 2026-08-12 22:50 by sdfapple719
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
信息提示
请填处理意见