| 查看: 1582 | 回复: 5 | ||||
liuyihua铁杆木虫 (小有名气)
|
[交流]
【分享】Tinker 5出来啦！ 已有1人参与
|
|
简介 TINKER是一些程序的集合，用于进行分子力学和分子动力学计算，以及一些用于生物聚合物计算的特殊功能。注意新旧版本之间的很多计算并不兼容，因为它们的参数文件并不相同。 功能 1. 目前可以使用的力场有AMBER-94/96，CHARMM27，MM2(1991)，MM3(2000)，OPLS-AA和OPLS-UA。其它的力场UFF，ENCAD，MMFF和MM4正在构建中。另外，基于极化原子多极静电的TINKER力场也正在开发中。 2. TINKER包含多种算法：较通常方法快的新型距离-结构度量化方法，Elber的反应路径方法，用于全局优化的几种势能曲面平滑和寻找(PSS)方法，高效的势能曲面扫描程序，基于原子多极的静电偶极极化率，用几种不同的广义Born (GB/SA)模型进行连续的溶剂处理，高效简化的Newton (TNCG)定位优化程序，表面面积和体积，简单的自由能微扰工具，简正模式分析，直角坐标最小值，扭转或刚体空间，速率Verlet随机动力学，改善的球面能量截断方法，用于部分电荷的粒子网格Ewald总和，用于极化多极矩的常规Ewald总和，最新的长程静电反应场处理方法，模拟退火，构像寻找，MD的Andersen随机碰撞恒温，等等。 3. 改善的晶体最小化算法。 4. TINKER可以结合RasMol，ChemDraw，Chem3D，gOpenMol，MOLDEN，GAMESS-US和ReView使用。 5. PDB文件可以转化为TINKER文件，使得分子结构的输入有丰富的来源。 6. 对无穷聚合体，如金刚石和石墨进行操作。 官方主页: http://dasher.wustl.edu/tinker/ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 水和水的研究 |
» 猜你喜欢
河南理工大学招收材料，化工，化学调剂生
已经有0人回复
-
国家级人才课题组招收2026年化学，材料化工 调剂生
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有171人回复
-
国家级人才团体课题组招收2026届化学类学硕，专硕。
已经有1人回复
-
河南理工大学绿色催化课题组招收材料，化工，化学等方向研究生
已经有0人回复
-
硕士研究生调剂
已经有0人回复
-
国家级人才课题组招研究生 （催化方向）调剂
已经有13人回复
-
[天津]中国民航大学 招收材料类研究生
已经有0人回复
-
国家大人才课题组招收化学、材料化工类2026年调剂生
已经有0人回复
-
浙师大化与材学院2026年有大量硕士研究生调剂名额 （线上 调剂）
已经有7人回复
-
吉林工程技术师范学院 材料与化工 （0856） 招收调剂
已经有4人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 求助！！！关于zeta potential！强帖高奖励啦~~~
已经有6人回复
- Hummers方法制备氧化石墨，加5%双氧水，没颜色出来
已经有10人回复
- 关于羧基的硅烷保护问题，谢谢各位啦！
已经有4人回复
- 考研分数出来了，心情忐忑，请求前辈们指点！
已经有9人回复
- 为什么VASP算出来Gd的磁矩总是偏小？
已经有14人回复
- 重结晶之后，点板溶剂不一样，结果截然不同~~！！有木有？谢谢各位高手啦~~
已经有6人回复
- [size=5]外源基因原核表达遭遇种种瓶颈，求各位高手近来解答[/size]
已经有13人回复
- 求助高手有关Tinker编译问题!
已经有5人回复
- 求助！农杆菌侵染霉菌孢子的问题。谢谢大家啦
已经有5人回复
- tinker5.0编译出错
已经有8人回复
- 用tinker的amoeba09力场模拟~~总是提示参数未定义~~~怎么办啊~热切求助
已经有7人回复
- 请教大家下列各酸在醋酸中的强弱，主要是HF酸不知道排哪 谢谢啦
已经有6人回复
- 【求助】tinker安装的问题
已经有3人回复
yalefield
金虫 (文坛精英)
老汉一枚
- QC强帖: 1
- 应助: 129 (高中生)
- 贵宾: 0.17
- 金币: 21238.9
- 散金: 3440
- 红花: 66
- 帖子: 12101
- 在线: 759.1小时
- 虫号: 96063
- 注册: 2005-10-07
- 专业: 高等教育学
- 管辖: 计算模拟
2楼2009-07-31 14:20:45
3楼2009-08-01 10:26:56
snoopyzhao
至尊木虫 (职业作家)
- QC强帖: 1
- 应助: 157 (高中生)
- 贵宾: 0.02
- 金币: 18844.7
- 红花: 29
- 帖子: 3803
- 在线: 1422.4小时
- 虫号: 183750
- 注册: 2006-02-13
- 专业: 污染生态化学
4楼2009-08-02 10:17:05
yalefield
金虫 (文坛精英)
老汉一枚
- QC强帖: 1
- 应助: 129 (高中生)
- 贵宾: 0.17
- 金币: 21238.9
- 散金: 3440
- 红花: 66
- 帖子: 12101
- 在线: 759.1小时
- 虫号: 96063
- 注册: 2005-10-07
- 专业: 高等教育学
- 管辖: 计算模拟
5楼2009-08-02 10:45:25
plafalines
捐助贵宾 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 27.1
- 散金: 21
- 红花: 8
- 帖子: 89
- 在线: 116.9小时
- 虫号: 1051786
- 注册: 2010-07-04
- 专业: 理论和计算化学
6楼2011-03-25 15:57:24
