| 查看: 3729 | 回复: 1 | ||
[求助]
应用wincoot 和CCP4i 解决蛋白和小分子化合物共结晶时，小分子化合物的定位问题
|
|
请教：我需要解决蛋白和小分子化合物共结晶时，小分子化合物的定位问题。当应用wincoot把小分子化合物插到蛋白中可能的电子云密度里，merge分子，生成新的PDB文件，请问这样有没有错？然后当我再把生成的PDB文件和此蛋白的MTZ文件输入到CCP4i中时，CCP4i运行显示Fail， 不知这其中的症结在何处？是我的方法不正确，还是缺少其他的软件？ 错误显示如下： ERROR : UNK : duplicated atom_name : "C ". chain: XX residue: 0 ERROR : UNK : duplicated atom_name : "C ". chain: XX residue: 0 ERROR : UNK : duplicated atom_name : "C ". chain: XX residue: 0 ERROR : UNK : duplicated atom_name : "C ". chain: XX residue: 0 ERROR : UNK : duplicated atom_name : "C ". ............................................ |
回复此楼» 猜你喜欢
考研调剂
已经有7人回复
-
0856调剂
已经有4人回复
-
材料277求调剂
已经有5人回复
-
一志愿北京化工大学材料与化工（085600）296求调剂
已经有6人回复
-
资源与环境 调剂申请(333分)
已经有8人回复
-
334分 一志愿武理 材料求调剂
已经有3人回复
-
284求调剂
已经有5人回复
-
0703化学/290求调剂/本科经历丰富/工科也可
已经有6人回复
-
北科281学硕材料求调剂
已经有18人回复
-
275求调剂
已经有9人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 了解蛋白质性质及其熟悉电泳的高手请进！
已经有11人回复
- 【资料】武汉大学分子遗传学笔记
已经有76人回复
- 请教各位高人，基因克隆表达的流程是什么？
已经有8人回复
- PCR产物测序结果
已经有8人回复
- 新手提RNA，请教几个问题
已经有8人回复
- DNA 条带 和 OD值
已经有13人回复
- 细胞培养基能冷冻吗
已经有9人回复
- 凝胶层析上样问题
已经有11人回复
- 用过pET28a(+)表达载体的高人请指教
已经有31人回复
- DNA变性PAGE后大家是用什么染DNA的呢？呵呵
已经有15人回复
- 如何做一个小分子化合物与蛋白结构的Binding
已经有11人回复
2楼2020-01-02 20:59:10
20