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yhyffrshuh

木虫 (正式写手)

流浪者一枚

[交流] 分子3D结构.mol格式直接下载,不用画 已有4人参与

分子3D结构.mol格式直接在http://www.chemspider.com/下载,然后用chemdraw、GaussianView直接打开就可以,不用画。

有个问题就是:不知道这样的结构是不是合理?
在GaussianView中分子的坐标(内坐标)都是自己设定的,在不知道分子中原子间的距离时,很难设定分子的坐标参数。虽然分子结构是要优化的,但是也要初始结构合理,怎么算合理?

结构是否合理,参考帖子:
1、怎样判断优化后的构型是稳定的、合理的?
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=23671380

2、【小卒个人文集】中的“关于作图”——《分子构型调整过程实例》
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2780571

3、百度:《原子轨道杂化方式的判断与分子结构合理推定__省略_bital理论与VSEPR理论》
http://wenku.baidu.com/view/b61b8d00b52acfc789ebc9d9.html


目前就找到这些,(2岁的宝贝看我用GaussianView移动、放大、缩小分子,她说我的分子在跳舞,玩了半天GaussianView)我都还没看完。贴这里明天继续学习

[ Last edited by yhyffrshuh on 2011-7-31 at 23:34 ]
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天下枫叶

木虫 (著名写手)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
1楼: Originally posted by yhyffrshuh at 2011-07-31 09:13:28:
分子3D结构.mol格式直接在http://www.chemspider.com/下载,然后用chemdraw、GaussianView直接打开就可以,不用画。

有个问题就是:不知道这样的结构是不是合理?
在GaussianView中分子的坐标(内 ...

2岁的宝贝很可爱啊,会说话不
2楼2011-08-01 08:55:47
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顶一下~
3楼2011-08-01 09:26:00
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hexingyi

木虫 (职业作家)


★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个网址确实很好用,很多分子结构就不用自己画完后慢慢优化了!
4楼2013-11-29 12:53:16
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追海寻贝

新虫 (小有名气)

感谢楼主!!!
5楼2019-02-21 10:45:54
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