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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 其他 » 分子3D结构.mol格式直接下载，不用画
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yhyffrshuh

木虫 (正式写手)

流浪者一枚

[交流] 分子3D结构.mol格式直接下载，不用画已有4人参与

分子3D结构.mol格式直接在http://www.chemspider.com/下载，然后用chemdraw、GaussianView直接打开就可以，不用画。

有个问题就是：不知道这样的结构是不是合理？
在GaussianView中分子的坐标（内坐标）都是自己设定的，在不知道分子中原子间的距离时，很难设定分子的坐标参数。虽然分子结构是要优化的，但是也要初始结构合理，怎么算合理？

结构是否合理，参考帖子：
1、怎样判断优化后的构型是稳定的、合理的？
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=23671380

2、【小卒个人文集】中的“关于作图”——《分子构型调整过程实例》
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2780571

3、百度：《原子轨道杂化方式的判断与分子结构合理推定__省略_bital理论与VSEPR理论》
http://wenku.baidu.com/view/b61b8d00b52acfc789ebc9d9.html

目前就找到这些，（2岁的宝贝看我用GaussianView移动、放大、缩小分子，她说我的分子在跳舞，玩了半天GaussianView）我都还没看完。贴这里明天继续学习

[ Last edited by yhyffrshuh on 2011-7-31 at 23:34 ]
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1楼2011-07-31 09:13:28
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hexingyi

木虫 (职业作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
这个网址确实很好用，很多分子结构就不用自己画完后慢慢优化了！
赞一下 回复此楼
4楼2013-11-29 12:53:16
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天下枫叶

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
1楼: Originally posted by yhyffrshuh at 2011-07-31 09:13:28:
分子3D结构.mol格式直接在http://www.chemspider.com/下载，然后用chemdraw、GaussianView直接打开就可以，不用画。

有个问题就是：不知道这样的结构是不是合理？
在GaussianView中分子的坐标（内 ...

2岁的宝贝很可爱啊，会说话不
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-08-01 08:55:47
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