24小时热门版块排行榜    

查看: 1910  |  回复: 17
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

李佳佳佳

金虫 (正式写手)

Alice

[求助] 下图是怎么做的

请问下图中charge是如何与能带图中的带对应起来的?怎么做局部的电荷啊?在电荷密度图上能看出来什么性质啊?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

停不下的马蹄,滴答滴答~
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jaymimi

木虫 (正式写手)

.

【答案】应助回帖

franch(金币+2): 谢谢回帖交流 2011-07-25 12:43:15
bingmou(金币-2): 转载请注明来源!而且转载内容与本贴无关 2011-07-26 09:00:00
李佳佳佳(金币+1): 2011-07-30 17:53:04
如从上面的HF分子的σ键电子密度差图Δρ,并参照MO系数来看,这个σ键可以分析为三个内含:

第一、原子以基组形式参与成键,这基组或者可以看作是广义的杂化。        
对于成键来说,基组一方面是为了弥合不同AO的波形的差距,融合成平滑、完整、统一的MO,另一方面是为了应对键间电子向键轴的聚集、收缩和原子之间的电子转移。
基组不仅是计算需要的一组数学表达式,当它们分配了系数、安排了电子,它就形成了一个新的广义杂化的空间AO,是具有能级值或说是电负性的,是有确定物理意义的,它是成键电子的载体、基础。

第二、电子在不同电负性原子之间转移。
从HF分子Δρ图可以清楚地看到,H缺失了大量的电子,导致电负性升高;F增加了大量的电子,导致电负性降低,直至二者电负性相等、均衡。
有趣的是,通常说sp杂化,用增大的一瓣去成键以增大重叠能力。但在HF中,MO的基组中s、p却是反位相的杂化,即HF以缩小的一瓣去成键,而用增大的一瓣去装转移过来的过多电子,这转移电子妥善安排在离键区远的外面集结。

第三、电子向键中间中移。
从HF分子Δρ图看,在H和F之间也有明显的电子聚集。这是人所共知的成键的关键表征。

此外,这种电子往键中间聚集、形成对二核的屏蔽加强,会减小原子核之间的排斥力,有利于降低体系的总体能量。

然而,所有上面这一些图形功能,单从gs03 cube并不能直接、方便地得到。

对于G03来说,它的cubegen是能作density和Orbitals等的空间格点的。
但是它的density(ρ)只是全分子的,分子的所有MO的电子密度加和,还自然包含分子中的1S、2S轨道,用图形展示出来是一个圆滚滚的样子,很难说明什么,也不利作密度差。

我们常常需要考察的是分子成键的单个特定的MO(或者孤对电子MO等)。
而G03的cubegen不能作某个MO的ρ,将某个MO的cube输入到cubman也不能作平方运算作成ρ,因为cubman缺少平方运算。

而且cubegen的空间数值格点输出文件,是没有坐标的。它的坐标隐含在输出文件的开始部分:空间网格每个边的格点数、空间格点的起始点、格点间隔。除了与其配套的软件外,其它软件很难用这个数据加工或作图。

Sobereva 博士专门开发的gsgrid程序就是为解决上述问题制作的,它把格点文件的数据提取出来,附上每个数据点的坐标。可以选取指定的XY/YZ/XZ平面,得到这个平面上的数据点以便做等值线图(MO图、ρ图),或对数据进行各种运算加工(作平方、作差值等),然后再作等值线图(Δρ图)。
gsgrid程序附有详细的使用说明,一看就会。

而进入高超的sigmaplot中作等值线,更是功能强大、得心应手!
我很低调。。。。。。
5楼2011-07-25 10:54:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 18 个回答

zhouqihanshu

木虫 (正式写手)

爱我所爱

给你顶个,我也不知道,看看有高人没
Whether the weather is fine or not!
2楼2011-07-25 08:55:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

李佳佳佳

金虫 (正式写手)

Alice

引用回帖:
Originally posted by zhouqihanshu at 2011-07-25 08:55:31:
给你顶个,我也不知道,看看有高人没

是啊,我觉得这个图做的很好,也细致,就是不知道中间的怎么分析,又是怎么做出来的~~
停不下的马蹄,滴答滴答~
3楼2011-07-25 09:54:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
franch(金币+3): 谢谢回帖交流 2011-07-25 12:42:02
李佳佳佳(金币+1): 2011-07-30 17:52:41
看说明书吧 里面有讲的
给你中文的,转载别人的http://hi.baidu.com/heyi87/blog/ ... 791e94b2b7dc89.html
嘟啦啦嘟啦啦嘟
4楼2011-07-25 10:36:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 286分人工智能专业请求调剂愿意跨考! +4 lemonzzn 2026-03-17 8/400 2026-03-21 22:49 by lemonzzn
[考研] 考研调剂 +3 呼呼?~+123456 2026-03-21 3/150 2026-03-21 20:04 by 无际的草原
[考研] 333求调剂 +5 87639 2026-03-21 7/350 2026-03-21 19:31 by ColorlessPI
[考研] 考研化学学硕调剂,一志愿985 +5 张vvvv 2026-03-15 7/350 2026-03-21 19:23 by ColorlessPI
[考研] 工科0856求调剂 +3 沐析汀汀 2026-03-21 3/150 2026-03-21 18:30 by 学员8dgXkO
[考研] 求调剂 +3 13341 2026-03-20 3/150 2026-03-21 18:28 by 学员8dgXkO
[考研] 0703化学297求调剂 +3 Daisy☆ 2026-03-20 3/150 2026-03-21 17:45 by ColorlessPI
[考研] 306求0703调剂一志愿华中师范 +5 纸鱼ly 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:11 by 学员8dgXkO
[考研] 306求调剂 +4 chuanzhu川烛 2026-03-18 4/200 2026-03-21 08:25 by laoshidan
[考研] 08工科 320总分 求调剂 +6 梨花珞晚风 2026-03-17 6/300 2026-03-21 03:40 by JourneyLucky
[考研] 324分 085600材料化工求调剂 +4 llllkkkhh 2026-03-18 4/200 2026-03-21 01:24 by JourneyLucky
[考研] 321求调剂 +9 何润采123 2026-03-18 11/550 2026-03-20 23:19 by JourneyLucky
[考研] 一志愿苏州大学材料求调剂,总分315(英一) +5 sbdksD 2026-03-19 5/250 2026-03-20 22:10 by luoyongfeng
[考研] 一志愿西南交通 专硕 材料355 本科双非 求调剂 +5 西南交通专材355 2026-03-19 5/250 2026-03-20 21:10 by JourneyLucky
[考研] 一志愿南理工085701环境302求调剂院校 +3 葵梓卫队 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:28 by zhukairuo
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +7 困于星晨 2026-03-17 9/450 2026-03-20 17:38 by 无懈可击111
[考研] 一志愿福大288有机化学,求调剂 +3 小木虫200408204 2026-03-18 3/150 2026-03-19 13:31 by houyaoxu
[考研] 一志愿南京大学,080500材料科学与工程,调剂 +4 Jy? 2026-03-16 4/200 2026-03-17 11:02 by gaoqiong
[考研] 机械专硕325,寻找调剂院校 +3 y9999 2026-03-15 5/250 2026-03-16 19:58 by y9999
[考研] 070300化学学硕求调剂 +6 太想进步了0608 2026-03-16 6/300 2026-03-16 16:13 by kykm678
信息提示
请填处理意见