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学游泳的鱼8672

新虫 (初入文坛)

[求助] 分子克隆菜鸟求助:未知序列分析

分子克隆菜鸟求助:前段时间克隆出来一个序列,有625bp。在NCBI上该片段只有很短的区域能比对上,且比对上的这部分序列E值都比较大。但这段序列的前后都为可移动元件。初步分析了一下,在538-600bp处有一个蛋白编码区,还有5个调控单元分布在这段序列上。没有启动子,请各位大虾指教一下,该如何对该片段进行进一步分析?(我的实验目的是用RAPD筛选物种特异的重复序列)。这是不是已经可以排除它是重复序列的可能性了?如果是基因,是不是可以向两边再拉一下?
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