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dndxwoaini

新虫 (小有名气)

[交流] gromacs修改源码,是编译前修改,还是编译后修改? 已有2人参与

gromacs修改源码,是编译前修改,还是编译后修改,我发现编译好的,只能在include下找到.h的头文件,反而没编译的有.c文件。。。
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ghcacj

荣誉版主 (著名写手)

阿超

优秀版主

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-07-20 14:43:37
肯定是修改后编译,都编译好了,修改有啥用
2楼2011-07-20 11:12:54
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dubo

金虫 (著名写手)

优秀版主

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
御剑江湖(金币+5): 谢谢 2011-07-20 14:43:59
御剑江湖(模拟EPI+1): 谢谢 2011-07-20 14:44:22
最好是这样:
1、把GROMACS全部编译一遍
2、修改代码,但是原来的最好做个备份
3、然后编译自己的代码,生成的可执行文件最好与系统的不同
命令行如:

mpicc template.c  -o calc -g -lmd_mpi -lgmx_mpi -L/export/software/local/gromacs-3.3.1/lib -L/export/software/local/fftw-2.1.5/lib -L/usr/lib64 -L/usr/lib64 -lnsl -lsrfftw -lsfftw  -lXm -lXt  -lSM -lICE -lXext -lXp -lX11 -tpp7 -axW -ip -w -funroll-all-loops -db -I/export/software/local/gromacs-3.3.1/include/gromacs
3楼2011-07-20 11:32:12
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dndxwoaini

新虫 (小有名气)

谢谢楼上2位的回答,新手还要改源码,很痛苦
4楼2011-07-24 09:47:13
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dndxwoaini

新虫 (小有名气)

如果我想使其中一个原子做简谐振动,有什么思路可以提供吗,谢谢
5楼2011-07-24 09:51:06
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