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gxsulong

至尊木虫 (著名写手)

[求助] Gromacs怎么分析氢键存活时间?

用Gromacs怎么分析氢键存活时间?我看论坛上说用g_hbond -ac 或者-life来分析,下面两个图是我分析出来的结果,我看不懂。大家帮我看看每列代表什么。谢谢!


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霉菌
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xunweiyang

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by xiaowu759 at 2014-05-16 18:05:56
it means the distribution of lifetimes...

请问下您知道s0 和s1这两列是什么意思吗?跟求氢键存活时间有什么关系啊?
8楼2015-04-08 10:35:29
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查看全部 14 个回答

dubo

金虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-07-20 14:42:50
gxsulong(金币+3): 谢谢 2011-07-21 07:40:04
用ORIGIN做个图,然后根据氢键的性质,算一下时间应该就可以
2楼2011-07-20 11:35:24
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gxsulong

至尊木虫 (著名写手)

怎么算时间呢?图上的几列都不知道代表什么。
霉菌
3楼2011-07-21 07:41:10
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xiaowu759

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
gxsulong(金币+1): 2011-07-21 08:32:58
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-07-21 14:07:46
gxsulong(金币+2): 谢谢 2011-07-22 08:20:16
不是输出文件中写着吗?
s0 legend ...
s1 legend ...
s2 legend ...
s3 legend ...
4楼2011-07-21 08:05:57
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