| 查看: 3150 | 回复: 41 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
Gaussian几何优化后的键长不合理
|
||
|
用Gaussian 09做分子几何优化。分子的部分结构见图1，具有两个手性中心（C3和C6）。几何优化分步过程如下：先用chem3D MM2做初步优化，再用PM3优化（包括频率分析），接下来用RHF 6-31G做优化（包括频率分析），计算均成功完成。但是分子中的碳硫键C3-S1（图1），经PM3优化后，键长1.882埃，基本合理，经RHF 6-31G优化后竟然变成3.172埃，显然是不合理的。我的疑问如下： 我的这种分步优化应该是合理的吧？ 键长不合理的情况是否与分子中包含手性中心有关？因为C3是手性的，导致gaussian对碳硫键的处理不合理？（另一个手性中心C6周围的键长均在合理范围内） gaussian中对手性分子的几何优化有什么需要特别注意的吗？ 6-31G的基组对于处理硫这样的原子足够吗？ 补充：刚看到其他的帖子，认为初始分子的构型是否合理，对找到正确的优化结构很关键？那么我的分步优化产生的构型是否是比较合理的构型呢？  [ Last edited by jianqin on 2011-7-15 at 09:40 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
祈福论文小修
已经有21人回复
-
香港理工大学计算材料与物理课题组招聘博后
已经有15人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有103人回复
-
香港理工大学计算材料与物理课题组招聘博后
已经有15人回复
-
西班牙Institut Català de Nanociència i Nanotecnologia, CSIC-BIST招收公派博士生
已经有0人回复
-
英国利物浦大学屠昕和雍雪课题组招收CSC博士生
已经有27人回复
-
北京交通大学王熙教授团队招收2026年入学催化方向博士研究生（还有1个名额）
已经有0人回复
-
华北电力大学（北京）（第一性原理计算）博士招生——学博，专博各1人
已经有45人回复
-
英国贝尔法斯特女王大学招收 2026 年 CSC/BBSRC phd 机器学习 催化剂设计方向
已经有0人回复
-
法国里昂大学招生CSC 资助博士生
已经有0人回复
-
法国里昂大学接收CSC 资助访问学者
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
B4-449
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 62 (初中生)
- 贵宾: 0.218
- 金币: 7842.6
- 散金: 330
- 红花: 37
- 沙发: 2
- 帖子: 1675
- 在线: 787小时
- 虫号: 1140943
- 注册: 2010-11-07
- 性别: GG
- 专业: 生物力学与生物流变学
37楼2011-07-25 10:45:11
fatpig8832
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 16 (小学生)
- 金币: 7420.2
- 散金: 31
- 红花: 28
- 帖子: 1438
- 在线: 610.9小时
- 虫号: 770403
- 注册: 2009-05-14
2楼2011-07-15 10:20:09
3楼2011-07-15 10:33:52
fatpig8832
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 16 (小学生)
- 金币: 7420.2
- 散金: 31
- 红花: 28
- 帖子: 1438
- 在线: 610.9小时
- 虫号: 770403
- 注册: 2009-05-14
4楼2011-07-15 12:00:35