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Gaussian几何优化后的键长不合理
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用Gaussian 09做分子几何优化。分子的部分结构见图1，具有两个手性中心（C3和C6）。几何优化分步过程如下：先用chem3D MM2做初步优化，再用PM3优化（包括频率分析），接下来用RHF 6-31G做优化（包括频率分析），计算均成功完成。但是分子中的碳硫键C3-S1（图1），经PM3优化后，键长1.882埃，基本合理，经RHF 6-31G优化后竟然变成3.172埃，显然是不合理的。我的疑问如下： 我的这种分步优化应该是合理的吧？ 键长不合理的情况是否与分子中包含手性中心有关？因为C3是手性的，导致gaussian对碳硫键的处理不合理？（另一个手性中心C6周围的键长均在合理范围内） gaussian中对手性分子的几何优化有什么需要特别注意的吗？ 6-31G的基组对于处理硫这样的原子足够吗？ 补充：刚看到其他的帖子，认为初始分子的构型是否合理，对找到正确的优化结构很关键？那么我的分步优化产生的构型是否是比较合理的构型呢？  [ Last edited by jianqin on 2011-7-15 at 09:40 ] |
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谢谢！虽然我不知道这个E(uhf)=-1289.08035487代表的物理意义，但是这个值应该比单重态的小。 单重态，rhf 6-31g能量结果： Zero-point correction= 0.358864 (Hartree/Particle) Thermal correction to Energy= 0.379415 Thermal correction to Enthalpy= 0.380359 Thermal correction to Gibbs Free Energy= 0.305788 Sum of electronic and zero-point Energies= -1288.405788 Sum of electronic and thermal Energies= -1288.385237 Sum of electronic and thermal Enthalpies= -1288.384293 Sum of electronic and thermal Free Energies= -1288.458864 |
36楼2011-07-25 08:42:08
fatpig8832
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2楼2011-07-15 10:20:09
3楼2011-07-15 10:33:52
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4楼2011-07-15 12:00:35
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