| 查看: 4354 | 回复: 41 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
Gaussian几何优化后的键长不合理
|
||
|
用Gaussian 09做分子几何优化。分子的部分结构见图1，具有两个手性中心（C3和C6）。几何优化分步过程如下：先用chem3D MM2做初步优化，再用PM3优化（包括频率分析），接下来用RHF 6-31G做优化（包括频率分析），计算均成功完成。但是分子中的碳硫键C3-S1（图1），经PM3优化后，键长1.882埃，基本合理，经RHF 6-31G优化后竟然变成3.172埃，显然是不合理的。我的疑问如下： 我的这种分步优化应该是合理的吧？ 键长不合理的情况是否与分子中包含手性中心有关？因为C3是手性的，导致gaussian对碳硫键的处理不合理？（另一个手性中心C6周围的键长均在合理范围内） gaussian中对手性分子的几何优化有什么需要特别注意的吗？ 6-31G的基组对于处理硫这样的原子足够吗？ 补充：刚看到其他的帖子，认为初始分子的构型是否合理，对找到正确的优化结构很关键？那么我的分步优化产生的构型是否是比较合理的构型呢？  [ Last edited by jianqin on 2011-7-15 at 09:40 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
中科院西安光机所——促进学术交流，推动产学研融合，分享领域成果，加强校企合作。
已经有0人回复
-
分子动力学 Plumed教程求助
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有184人回复
-
研究生学术新锐奖｜宁波微纳材料研讨会参会通知
已经有2人回复
-
申请2027年材料/化学类博士
已经有6人回复
-
求相关合成条件
已经有12人回复
-
2027春季申博自荐
已经有6人回复
-
青基的材料青椒们，可以把硕士联培生送我这里，要研二男生
已经有63人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
25楼2011-07-19 09:18:44
fatpig8832
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 16 (小学生)
- 金币: 7420.2
- 散金: 31
- 红花: 28
- 帖子: 1438
- 在线: 610.9小时
- 虫号: 770403
- 注册: 2009-05-14
2楼2011-07-15 10:20:09
3楼2011-07-15 10:33:52
fatpig8832
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 16 (小学生)
- 金币: 7420.2
- 散金: 31
- 红花: 28
- 帖子: 1438
- 在线: 610.9小时
- 虫号: 770403
- 注册: 2009-05-14
4楼2011-07-15 12:00:35
10