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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » autodock运行时Can't create log file
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xjwlika

新虫 (初入文坛)

[求助] autodock运行时Can't create log file

我运行autogrid 是成功的 但是一运行autodock就有问题 其中一个就是 can't create  log file
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1楼 2011-06-30 16:57:32
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xd200620940

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
ghcacj(金币+4): 谢谢 2011-10-17 13:30:54
毫无疑问，出现这种情况是因为pdb文件或mol2文件存在问题！为什么呢？因为pdbqt文件是根据pdb文件或mol2文件而得到的。出现这种情况可能是因为存在autodock不能识别的原子或者其他原因导致grid map不能正确的被计算。因此，建议：检查pdb文件或mol2文件。只要这个没问题，grid和dock的步骤是没有任何问题的。
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5楼2011-10-16 21:12:14
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icedreamer

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-07-08 16:49:29
我也出现了同样的情况，不过我觉得您应该注意对话框里面的话，而不是AD里面的话，对话框里面会显示很多error,例如我的就是Attribute error:'NoneType' object has no attribute 'gridcenter'
也就是说之前准备受体的时候就出错了，我相信你的应该也是这样的
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2楼2011-07-08 15:37:08
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icedreamer

新虫 (小有名气)
★
御剑江湖(金币+1): 伟大。。。 2011-07-12 17:17:36
我还给你回帖呢，我自己也出现了这样的问题~~
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3楼2011-07-12 11:18:19
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xjwlika

新虫 (初入文坛)
希望你的问题解决了
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4楼2011-10-14 11:12:10
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