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lyx20041102

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
wickhamhan(金币+1): 2011-06-17 08:38:43
西瓜(金币+3): 鼓励 2011-06-18 10:03:45
我做的是原核生物,ATG前500bp之内一般能有启动子了。
10楼2011-06-17 02:43:30
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查看全部 17 个回答

天使托

专家顾问 (职业作家)

T.Shen

【答案】应助回帖

★ ★
wickhamhan(金币+3): 2011-06-16 14:18:32
dhd997(金币+2): 鼓励之,看楼下 2011-06-16 15:00:29
往这个基因前面基因的终止子(TGA)前面扩上100bp,这是保证这个基因能带上启动子最稳妥的方法。。。
Whenever,Wherever,Anyway!MustRemember:Fight!KeepFighting!NeverGiveUp!
2楼2011-06-16 12:04:12
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yuxia82012

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
wickhamhan(金币+2): 2011-06-16 14:18:41
dhd997(金币+2): 鼓励 2011-06-16 15:00:42
有网址可以预测,但也是预测而已,最好是把这段基因弄下来搞到一个操纵子上游,看其能否启动这个操纵子表达
在等待中涅槃重生
3楼2011-06-16 12:37:10
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啮风

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
wickhamhan(金币+3): 2011-06-16 14:18:46
dhd997(金币+6, EPI+1): good 2011-06-16 15:00:53
已知全基因组序列,上有一个调控基因,请问如何确定它的启动子
+++++++++++++++++++++++因为楼主的专业上面写的是微生物生理类,所以我仅以简单的原核生物为例来回答这个问题。
正如三楼回答的,有许多网站可以预测原核生物的启动子区,注意是区,里面包含了,启动子区的核心要素:-35,-10, 转录起始为点。但是这是经验预测,那么如果你要发文章确认这一段DNA序列,那么你首先确认转录起始位点,一般是引物延伸分析(primer extension analysis),这个位点确认好后,然后再结合生物信息学预测,上推10个,35个BP,一般就OK了。当然,还有一种就是我只要这一段,我不需要具体的位点信息,那么一般是在这个基因的上游,分别取ATG上游100BP, 101-200BP等等,然后将这些片断分别连接到无LAC启动子区的LACZ基因上游(这个LACZ基因是没有本身启动子的,基因的表达就要依赖你连接片断启动子活性的有无),然后通过IPTG诱导,测量半乳糖苷酶的活性来找到这个启动子区。
4楼2011-06-16 13:14:59
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