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啮风

铜虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
wickhamhan(金币+3): 2011-06-16 14:18:46
dhd997(金币+6, EPI+1): good 2011-06-16 15:00:53

已知全基因组序列，上有一个调控基因，请问如何确定它的启动子
+++++++++++++++++++++++因为楼主的专业上面写的是微生物生理类，所以我仅以简单的原核生物为例来回答这个问题。
正如三楼回答的，有许多网站可以预测原核生物的启动子区，注意是区，里面包含了，启动子区的核心要素：-35，-10，转录起始为点。但是这是经验预测，那么如果你要发文章确认这一段DNA序列，那么你首先确认转录起始位点，一般是引物延伸分析（primer extension analysis），这个位点确认好后，然后再结合生物信息学预测，上推10个，35个BP，一般就OK了。当然，还有一种就是我只要这一段，我不需要具体的位点信息，那么一般是在这个基因的上游，分别取ATG上游100BP， 101-200BP等等，然后将这些片断分别连接到无LAC启动子区的LACZ基因上游（这个LACZ基因是没有本身启动子的，基因的表达就要依赖你连接片断启动子活性的有无），然后通过IPTG诱导，测量半乳糖苷酶的活性来找到这个启动子区。

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4楼2011-06-16 13:14:59

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