24小时热门版块排行榜    

查看: 3352  |  回复: 8
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

herarysara

木虫 (小有名气)

[求助] gaussian09输入文件

站内有很多关于linux下Gaussian 输入文件问题,可是还是不能解决,希望大家再帮帮忙。
问题:运行g09(g09 AuCl3.gjf)后出现:ntrex1: Bad file descriptor
同时检查了 l AuCl3.gjf more AuCl3.gjf 都没有问题。如图示。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

独孤狼

金虫 (正式写手)

独行者

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
zhou2009(金币+2): 2011-06-13 10:46:03
gmy1990(金币+2): 非常感谢你对论坛的贡献,奖励一下! 2011-06-13 10:52:19
https://bse.pnl.gov/bse/portal
楼主可以到上面的网站查一下基组适用范围,Au很明显不适合用3-21g算,推荐适用赝势场基组
cpu数,内存,使用的硬盘大小等等高斯一般有默认的设置,但最好还是自己设置好
轮回的过往,注定的未来;独孤的行者,孤独的路途……
6楼2011-06-13 10:43:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

herarysara

木虫 (小有名气)

同时 我想知道输入文件如果正确后,会有什么标志结果输出?
又应该怎样设置计算参数?初学者急用,谢谢大家...
2楼2011-06-13 10:12:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kaegi

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
zhou2009(金币+3): 2011-06-13 10:41:58
zhou2009(金币+3): 2011-06-13 10:44:10
herarysara(金币+50): 20 2011-06-13 14:50:18
引用回帖:
Originally posted by herarysara at 2011-06-13 10:11:10:
站内有很多关于linux下Gaussian 输入文件问题,可是还是不能解决,希望大家再帮帮忙。
问题:运行g09(g09 AuCl3.gjf)后出现:ntrex1: Bad file descriptor
同时检查了 l AuCl3.gjf more AuCl3.gjf 都没有问题 ...

楼主输入文件可能存在下面几个问题:一个是没有指定计算所使用的核数和内存,一般在开始用%nproc=3换行%mem=2GB来表示。
另外楼主计算的原子可能不适合用3-21这么小的基组,应该用赝势场基组才对。我写了一个com文件,以供楼主参考。里面的分子坐标请自行替换掉就可以了。
3楼2011-06-13 10:32:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kaegi

金虫 (小有名气)

还有那个chk文件我不知道这么写对不对,不过我建议就写成%chk=AuCl.chk就可以了。指定路径不清楚是否可以,楼主可以都试试看。
4楼2011-06-13 10:34:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 wsYGJnURYvm6 2026-08-31 3/150 2026-09-01 01:40 by o3EMxHUAQDtS
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +6 叶九微 2026-08-26 6/300 2026-08-31 23:54 by yudaoqian88
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 EZ67DG6CvcKL 2026-08-31 3/150 2026-08-31 22:23 by o3EMxHUAQDtS
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 EZ67DG6CvcKL 2026-08-31 3/150 2026-08-31 22:12 by o3EMxHUAQDtS
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 基金不中,共勉 +12 eulota 2026-08-26 12/600 2026-08-31 08:42 by ZJTJZ
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +6 gdd2018 2026-08-28 11/550 2026-08-30 08:58 by 超级无敌华子
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
信息提示
请填处理意见