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yuheng19831123

新虫 (初入文坛)

MolEPI: 1
应助: 3 (幼儿园)
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在线: 8.2小时
虫号: 532379
注册: 2008-03-25
专业: 环境微生物学

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
西瓜(金币+5, EPI+1): Good！一并奖励了。 2011-06-12 17:49:05
vs570588(金币+1): 有道理 2011-06-13 10:02:50

引用回帖:

Originally posted by vs570588 at 2011-06-12 09:53:40:
我的问题是这样的，DGGE只能跑PCR产物为几百的片段。但我们以前用引物534，和341，DGGE做出来还可以，但是切胶克隆测序后，序列根本就没有办法和已知GENBANK里的基因进行对比。所以我们就决定换引物，换引物后 ...

一般是100多到500这样子的，再大就不能良好的分析了，这是DGGE的一个缺陷，你原来的是190多的片段吧，好像是V3 的吧，太短了点，现在一般要求做长点了 V3-V6左右吧，还有本来你的样品中就是许多不可培养细菌，没有比对上的也可能正常，不过V3 的确也太短了。