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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 蛋白质3-d 结构预测
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shizishanshang

至尊木虫 (职业作家)

[交流] 蛋白质3-d 结构预测

请教各位，已经知道氨基酸序列，怎么预测蛋白的3－D结构呢？
看文章大都是说(homology-based modeling by swiss-Model），网址是http://
cn.expasy.org，但是我上了这个网址也不知道怎么预测啊？
提交了氨基酸序列，最后返回来的结果说是

Your sequence has no similar sequence of known structure.
Sorry, the ESyPred3D server can not build a model for your query.

唉，郁闷啊！
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1楼 2011-06-04 22:12:21
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无雪之冬

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
shizishanshang(金币+1):谢谢参与
silicare(金币+2): 欢迎常来生物综合版 2011-06-07 18:43:04
呵呵，我最近都在做整这个东东，我的是12mer的多肽，用ChemBioDraw Ultra 12.0这个软件的氨基酸工具可以构建多肽的结构，然后用ChemBio 3D里面的能量最小化工具优化出3D结构，我用的MM2和MMFF94算法，mopac老是不能用.
赞一下(4人) 回复此楼
4楼2011-06-07 16:12:13
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