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萝卜丝儿

木虫 (小有名气)

[求助] 求助啊!转质粒出现问题了!

从公司买来了一段基因(3.7kb),那段基因是连在公司提供的质粒(2.7KB+3.7kb)上的,然后拿回来后就转入E.coli,然后就是扩增,提质粒,酶切跑电泳,切胶回收(3.7kb),再把那个基因连到我们实验室自己构建的载体(7.3kb)上,然后再做E.coli转化,但是很妖的事情发生了!!涂版以后,挑取长出来的单克隆,扩增,提质粒,酶切鉴定,得出的结果是3.7kb+2.7kb。。。做了好多好多遍都是这个结果,然后还用了菌落pcr鉴定那个质粒上的基因,结果是正确的。。这到底是怎么回事啊?求各位帮忙啊!!

师兄一开始认为我实验技能不过关,然后自己上来做,也是这个情况,其他博后过来指导,结果也是这个,这到底是怎么回事啊?去磷酸化也做过了,但还是这个情况。。。
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silicare

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【答案】应助回帖

萝卜丝儿(金币+2): 2011-06-05 15:11:25
引用回帖:
Originally posted by 萝卜丝儿 at 2011-05-30 05:10:23:
操作方面绝对不存在问题,为了让这两个条带跑开,特地用长胶跑的,分的很开,但是第二个载体连另外设计的4个基因,情况都很好。。。就是唯独这一个情况很诡异。。。

超螺旋的速度可不是按规矩来的

你的没有切开的部分质粒是可以存在于你的大片段里的

你的对照做了吗

有没有直接把你回收的3.7kb片段做转化?有没有把你的3.7kb片段做一个自连,然后做转化?如果这个没做,说明你的实验本身设计就不够完善

从你的描述看,首要的怀疑点就是没完全切开,导致后续的失败

其次,还有注意是不是你的菌在转化似乎操作上污染,这样问题也需要做一个转化水的对照

你的问题是实验室做基因克隆常见的问题,一点都不诡异,见多了就自然不怪了,


顺便批评一下你的一句话,确切的说是你的态度:" 操作方面绝对不存在问题" 新手以后切忌说这句话!!

科研水深
8楼2011-05-30 11:59:22
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gongeleven

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

把2.7kb的测序吧。。。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
2楼2011-05-29 19:47:03
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lw582482481

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

萝卜丝儿(金币+1): 2011-06-05 15:11:06
你这个只能说明一个问题,实验污染了。
1.  首先是你构建的第一个质粒i,在酶切胶回收片段不纯,混有没有切干净的质粒或者载体片段,这都有可能。因为片段差距不是很大
2. 你们的第二个载体很大本身连接不是很好长克隆。

改进的方法就是你把第一个载体换一下,换成一个和你的目的片段大小差距较大的载体。
30而立
3楼2011-05-29 20:54:38
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萝卜丝儿

木虫 (小有名气)

silicare: why 2011-05-30 11:53:09
引用回帖:
Originally posted by gongeleven at 2011-05-29 12:47:03:
把2.7kb的测序吧。。。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]

我很早就跟师兄说了,但是貌似他不肯去测序。。。
好好学习,天天向上!
4楼2011-05-30 04:06:29
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