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lily_llf

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[求助] 为什么要进行能量最小化？

求教各位高手：
在用AutoDock作分子对接时，为什么要对小分子进行能量最小化？
我是在PDB中下载的SDF格式的3D小分子文件，用Chem3D转化成PDB格式的，还需要进行能量最小化吗？

感激！

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1楼2011-05-21 08:47:50

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lily_llf

新虫 (小有名气)

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引用回帖:

Originally posted by 痴梦潇湘 at 2011-05-21 10:19:54:
对接时，计算机会自动寻找小分子不同的构象进行对接，但寻找的方式有随机性，在你设置对接次数大时可能影响不大，但如果设置的次数少就可能没找到最低能构象，如果对接之前能量最小化了，不管设置的参数怎样， ...

明白了！感谢啊！

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