24小时热门版块排行榜    

查看: 2781  |  回复: 5

bjwang

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 请问:如何l利用xcrysden画电荷密度

我是才学这个作图软件,问一个低级的问题,如何做电荷密度图???我看有个网页(http://web.mit.edu/xcrysden_v1.4.1/www/XCRYSDEN/doc/menus.html )上说是从“properties”进去,选里面的电荷密度项,但我安装的程序上的按钮“properties”是灰色的(必须安装CRYSTAL GUI?);看官方网站上介绍说是从DataGrid进去(http://www.xcrysden.org/doc/density.html ),但我画的好像只是结构图,即使设置了Isosurface参数,好像也不能和文献一样,我是重复文献。
附:我画的18个na原子团簇的基态电荷密度图(看着怪怪的),

而文献的图(可能用opendx作):
  
这两者差别也太大了,哪位同学帮忙看一下问题出在哪?是我的方法的问题?还是我的数据问题?作密度图必须安装CRYSTAL GUI吗?谢谢了!!!

附件是我的原始数据文件。

[ Last edited by bjwang on 2011-4-28 at 14:28 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

第一性原理 科研工具 光催化专辑 超电+锂电

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

It is a shame for the soul to be first to give way in this life,when thy body does not give way.
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

quantumfang

至尊木虫 (职业作家)

小木虫中医研究院院长

【答案】应助回帖


bjwang(金币+5): 谢谢兄弟热情回帖,写的非常详细。其实我的数据是*.xsf文件,得到结构图没问题,下面操作和你说的完全一样,得到的就是前面的图。 2011-04-29 10:06:03
zsl_321123(金币+1): 感谢建议 2011-04-29 10:19:13
bjwang(金币+5): 再次感谢! 2011-05-07 10:54:52
1.在计算工作目录下用v2xsf将CHGCAR转为CHGCAR.xsf.gz
2.在xcrysden中打开CHGCAR.xsf.gz文件,得到结构图
3.Tools->Data Grid->
   菜单出来后,有一个地方可以改写数字参数,可以不改,点击OK
4.新窗口Isosurface controlling window弹出后,在菜单中,有一个数字框isovalue需要填写,填写0.~1之间的数字,点击submit看效果再次修改此数字。

可参考: http://www.xcrysden.org/doc/isocontrol.html

主要步骤是这一些,还可以进行精细调节
2楼2011-04-29 09:48:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bjwang

铁杆木虫 (正式写手)

非常感激前面同学的回复!我的数据输出就是xsf格式的,操作同上面同学说的完全一样,为什么我的图不是每个原子附近的电荷密度分布基本对称相同(同下图),是我的操作有误还是数据有误?哪位同学下载那个数据试验一下,麻烦大家了,谢谢了!!!
It is a shame for the soul to be first to give way in this life,when thy body does not give way.
3楼2011-04-29 10:13:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

quantumfang

至尊木虫 (职业作家)

小木虫中医研究院院长

你提供的density-sp1.xsf文件无法正常打开
不知什么问题
ERROR:An Error occured, while reading XSF file ....

所以还是你把所有输出文件发过来试做一下,如果不是太大的话
4楼2011-04-29 13:30:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bjwang

铁杆木虫 (正式写手)

内容已删除
It is a shame for the soul to be first to give way in this life,when thy body does not give way.
5楼2011-05-08 16:48:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sg18408926

至尊木虫 (著名写手)

不错,也在学
6楼2011-05-08 18:33:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 bjwang 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[文学芳草园] 伙伴们,祝我生日快乐吧 +17 myrtle 2026-03-10 26/1300 2026-03-16 18:32 by 青橙Ln
[考研] 一志愿985,本科211,0817化学工程与技术319求调剂 +5 Liwangman 2026-03-15 5/250 2026-03-16 17:10 by 我的船我的海
[考研] 283求调剂 +10 小楼。 2026-03-12 14/700 2026-03-16 16:08 by 13811244083
[考研] 中科院材料273求调剂 +4 yzydy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 15:59 by Gaodh_82
[考研] 材料与化工一志愿南昌大学327求调剂推荐 +7 Ncdx123456 2026-03-13 8/400 2026-03-16 12:15 by karry wen
[考研] 一志愿哈工大材料324分求调剂 +5 闫旭东 2026-03-14 5/250 2026-03-14 14:53 by 木瓜膏
[基金申请] 有必要更换申报口吗 20+3 fannyamoy 2026-03-11 3/150 2026-03-14 00:52 by zhanghaozhu
[考研] 调剂 +3 13853210211 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:47 by JourneyLucky
[考研] 一志愿华中农业大学071010,总分三百二,求调剂 +3 困困困困坤坤 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:35 by JourneyLucky
[考研] 318求调剂 +3 李新光 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:21 by JourneyLucky
[考研] 材料工程,326分,求调剂 +6 KRSLSR 2026-03-10 6/300 2026-03-13 23:47 by JourneyLucky
[考研] 341求调剂 +3 番茄头--- 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:07 by JourneyLucky
[考研] 材料工程调剂 +9 咪咪空空 2026-03-12 9/450 2026-03-13 22:05 by 星空星月
[考研] 0856材料与化工301求调剂 +5 奕束光 2026-03-13 5/250 2026-03-13 22:00 by 星空星月
[考研] 26调剂/材料/英一数二/总分289/已过A区线 +6 步川酷紫123 2026-03-13 6/300 2026-03-13 21:59 by 星空星月
[考研] 333求调剂 +3 球球古力 2026-03-11 3/150 2026-03-13 21:27 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +7 18880831720 2026-03-11 7/350 2026-03-13 16:10 by JourneyLucky
[考博] 26读博 +4 Rui135246 2026-03-12 10/500 2026-03-13 07:15 by gaobiao
[考研] 290求调剂 +3 柯淮然 2026-03-10 8/400 2026-03-11 13:48 by 柯淮然
[考博] 26申博求助 +3 跳跃饼干 2026-03-10 4/200 2026-03-10 21:15 by Tntcnn
信息提示
请填处理意见