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bjwang

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] vesta软件如何安装和画电荷密度图，谢谢

打算画电荷密度图，听说vesta不错，就下载安了个，但是在linux下解压后（解压不用安装？），执行./VASTA出来个图形界面，可以导入（file- open）xyz格式画出结构图，但是导入xsf格式的（看说明vesta支持这个格式），界面一闪就没了。是还需要安装（linux下）吗？还是我操作有误？哪位同学能详细说明一下vesta的安装及如何画电荷密度图，我的输出文件格式本身就是xsf格式。论坛上有几个类似的求助，但没人回答，可能问题太低级了。谢谢各位了！！！
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It is a shame for the soul to be first to give way in this life,when thy body does not give way.
1楼 2011-04-29 11:18:34
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fzx2008

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★
gzqdyouxia(金币+1): 谢谢提示 2011-04-29 18:19:41
bjwang(金币+5): 谢谢回复，有问题再请教 2011-04-30 13:15:19
无需安装，解压即用
支持xsf
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2楼2011-04-29 12:09:32
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youzhizhe

荣誉版主 (职业作家)

有志者

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★
bjwang(金币+5): 谢谢，能否说明一下画密度的大概过程？ 2011-04-30 13:16:45
zsl_321123(金币+1): 鼓励交流 2011-05-01 09:57:01
楼上正解 直接解压 进入到解压后的目录，./VESTA运行即可。完全可以正常使用的。
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微博http://weibo.com/10986069
3楼2011-04-29 15:37:00
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bjwang

铁杆木虫 (正式写手)
但我导入xsf文件时，界面一闪就关闭了，不知是什么原因？哪位同学帮忙试一试？输入文件见附件，谢谢！！！
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It is a shame for the soul to be first to give way in this life,when thy body does not give way.
4楼2011-04-30 14:39:45
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bjwang

铁杆木虫 (正式写手)
补充说明

我是通过如下途径导入文件的：file》open》然后找到xsf文件后点击ok。导入坐标文件xyz可以显示结构，但是导入xsf文件就退出，也没什么提示。
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It is a shame for the soul to be first to give way in this life,when thy body does not give way.
5楼2011-04-30 14:46:08
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ifmc1234

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
zsl_321123(金币+1): 鼓励交流 2011-05-01 09:57:20
引用回帖:
Originally posted by bjwang at 2011-04-30 14:46:08:
补充说明

我是通过如下途径导入文件的：file》open》然后找到xsf文件后点击ok。导入坐标文件xyz可以显示结构，但是导入xsf文件就退出，也没什么提示。

建议看一下vesta的xsf文件格式。我猜是你的输入文件格式问题。
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6楼2011-04-30 15:13:52
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bjwang

铁杆木虫 (正式写手)
我查阅了vesta的说明，又指向让查找xcrysden的说明：http://www.xcrysden.org/doc/XSF.html
我比较了一下，没看出哪里格式不对呀，哪位同学费心帮忙看看，谢谢了！！！
我把DATAGRID_3D_function改为BEGIN_DATAGRID_3D_function或BEGIN_DATAGRID3D_function都不行！

我的xsf文件：

ATOMS
        Na  -14.565000   10.000000   10.000000
        Na  -11.675000   10.000000   10.000000
        Na   -8.785000   10.000000   10.000000
        Na   -5.895000   10.000000   10.000000
        Na   -3.005000   10.000000   10.000000
        Na   -0.115000   10.000000   10.000000
        Na    2.775000   10.000000   10.000000
        Na    5.665000   10.000000   10.000000
        Na    8.555000   10.000000   10.000000
        Na   11.445000   10.000000   10.000000
        Na   14.335000   10.000000   10.000000
        Na   17.225000   10.000000   10.000000
        Na   20.115000   10.000000   10.000000
        Na   23.005000   10.000000   10.000000
        Na   25.895000   10.000000   10.000000
        Na   28.785000   10.000000   10.000000
        Na   31.675000   10.000000   10.000000
        Na   34.565000   10.000000   10.000000
BEGIN_BLOCK_DATAGRID3D
units: coords = A, function = A^-3
DATAGRID_3D_function
     81     81     81
0.0 0.0 0.0
   20.000000    0.000000    0.000000
    0.000000   20.000000    0.000000
    0.000000    0.000000   20.000000
        0.000000000000000
        0.000000000000000
        0.000000000000000
        0.000000000000000
        0.000000000000000
        0.000000000000000
       ...
      ....

      END_DATAGRID3D
END_BLOCK_DATAGRID3D
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It is a shame for the soul to be first to give way in this life,when thy body does not give way.
7楼2011-04-30 16:49:54
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锐利的碎片

木虫 (正式写手)

star watcher

【答案】应助回帖

★
gzqdyouxia(金币+1): 谢谢提示 2011-04-30 22:16:30
DATAGRID3D的格式不是这样的,vesta对xsf文件支持有限,最好转成vasp的格式.
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8楼2011-04-30 18:46:26
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bjwang

铁杆木虫 (正式写手)
这是我计算的那个程序直接输出的xsf格式，要转化话为vasp格式，不知道哪位同学有没有脚本之类的小程序以及如何转化？我只看到把vasp转为xsf的：如v2xsf。
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It is a shame for the soul to be first to give way in this life,when thy body does not give way.
9楼2011-05-01 09:46:21
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longxing

铜虫 (初入文坛)
我也出现了这个问题，请问解决了吗？
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10楼2019-07-05 10:47:10
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