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我们做荧光定量CT值有一个阈值线,这个阈值线可以手动调吗?
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hubeilj1108
铁虫
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(幼儿园)
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[交流]
我们做荧光定量CT值有一个阈值线,这个阈值线可以手动调吗?
我们做荧光定量CT值有一个阈值线,这个阈值线可以手动调吗?相同的基因我们需要把阈值线调到一个一个标准吗?那么这样手动调以后那么多板都要调的话会不会很麻烦,我想问那个机器自动生成的阈值线会不会相同的基因都是一个值
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2011-04-26 15:25:35
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Originally posted by
475502411
at 2011-04-26 18:53:36:
楼主说的挺详细的,我也知道阈值是可以调的,我有个问题:如果计算基因的相对表达量,也设有内参基因,不同版子跑出来的结果可以使用同一个参照样的ct值嘛?
你说的不同板子是指不同次的PCR吧?这个是不可以的哦。PCR是一个灵敏的反应,起始条件的细微改变都会造成很大的变化,而且影响PCR的因素很多,所以只有同一次跑的PCR样品才能比较。相对定量的话,如果没有内参也是可以比较的。内参可以矫正样品量的差异,如果精度要求不高,也是可以省的。但是如果要发表文章,内参基因是需要的。
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2011-04-26 20:02:06
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西瓜
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hubeilj1108(金币+1): 2011-04-26 19:09:02
dhd997(金币+5): good 2011-04-26 19:29:09
1.阈值线可以手动调的,只要是在指数扩增期就可以了,不会影响最后的结果。
2.阈值线不是针对某一个基因,是针对“同一次PCR”里面的所有样品、所有基因,并不是“相同的基因阈值线都一样”哦。不同次的PCR,阈值线一般不一样。
3.软件一般都可以根据某此PCR里所有样品的扩增曲线,自动设置阈值线。一般就用软件自动设置的就ok啦。
说得不是很详细,因为我觉得阈值的定义啥的你一定很清楚了。如果还不清楚就再问我吧
。
[
Last edited by 西瓜 on 2011-4-26 at 16:26
]
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2011-04-26 16:22:28
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hubeilj1108(金币+1): 2011-04-26 19:09:12
还真没调过,但是不同板的阈值是不一样的,也没有必要手动调。LZ可以看看这个
http://pathmicro.med.sc.edu/pcr/realtime-home.htm
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2011-04-26 16:30:04
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tank1917
at 2011-04-26 16:30:04:
还真没调过,但是不同板的阈值是不一样的,也没有必要手动调。LZ可以看看这个
http://pathmicro.med.sc.edu/pcr/realtime-home.htm
顶这个链接,呵呵
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4楼
2011-04-26 16:53:15
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