应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 请教用dmol跑团簇的分子动力学,如何分析稳定性
51/1返回列表
查看: 2253  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

ccwhhs

铜虫 (正式写手)

[求助] 请教用dmol跑团簇的分子动力学,如何分析稳定性

用dmol3跑一个团簇的分子动力学，用NVT系综，300K，如果经过几PS时间，团簇结构变形，那么该团簇稳定吗？
或者说初始结构能够保持几PS时间能说明它在常温下稳定？

[ Last edited by ccwhhs on 2011-4-24 at 07:23 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-04-23 12:10:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoboy185

金虫 (正式写手)
室温下保持稳定是基本的
一般来讲都应该在较高温度下跑下动力学再看看稳定性
结构变化不大就行
赞一下(1人) 回复此楼
7楼2012-03-05 12:54:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

ccwhhs

铜虫 (正式写手)
请大家帮帮忙！谢谢！！！
赞一下 回复此楼
2楼2011-04-24 08:08:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zsl_321123

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
franch(金币+2): 谢谢回帖交流 2011-08-01 10:10:04
ccwhhs(金币+30): 谢谢！！！参数已经帖出，希望继续关注。 2011-08-01 11:55:25
ccwhhs(金币+20): 谢谢！！！ 2011-08-03 06:33:35
your cluster is thermally unstable，


另外，不知道是否跟你的设置有关系。可以把你的详细设置列出来，让大家帮你分析分析。例如你用NVT，那么热浴的选择等。。。。
赞一下(1人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

ccwhhs
宁愿骑着自行车笑，不愿坐着宝马哭。。。。。
3楼2011-08-01 09:57:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ccwhhs

铜虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by zsl_321123 at 2011-08-01 09:57:30:
your cluster is thermally unstable，


另外，不知道是否跟你的设置有关系。可以把你的详细设置列出来，让大家帮你分析分析。例如你用NVT，那么热浴的选择等。。。。

以下是设置的参数，不知设置正确不？
# Task parameters
Calculate                     molecular_dynamics
Write_HIS_File         on
Write_ARC_File         on
MD_Velocity            random
MD_Time_Step        0.5000
MD_Simann_panel
   10000      NVT_NH     300.0000   2.0000
#

# Electronic parameters
Spin_polarization             unrestricted
Charge                        0
Basis                         dnp
Dftd                          obs
Pseudopotential               none
Functional                    gga(p91)
Aux_density                   octupole
Integration_grid              fine
Occupation                    thermal 0.0050
Cutoff_Global                 5.4000 angstrom
Scf_density_convergence       1.0000e-006
Scf_charge_mixing             0.2000
Scf_spin_mixing               0.5000
Scf_iterations                1000
Scf_diis                      6 pulay
赞一下 回复此楼
4楼2011-08-01 11:53:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 考研调剂 +6 来好运来来来 2026-03-21 7/350 2026-03-25 22:43 by 418490947
[考研] 网络空间安全0839招调剂 +4 w320357296 2026-03-25 6/300 2026-03-25 17:59 by 255671
[考研] 求b区院校调剂 +4 周56 2026-03-24 5/250 2026-03-25 17:12 by yishunmin
[考研] 各位老师您好：本人初试372分 +5 jj涌77 2026-03-25 6/300 2026-03-25 14:15 by mapenggao
[考研] 359求调剂 +3 王了个楠 2026-03-25 3/150 2026-03-25 12:50 by Dyhoer
[考研] 材料调剂 +3 iwinso 2026-03-23 3/150 2026-03-25 11:29 by greychen00
[考研] 271求调剂 +4 生如夏花… 2026-03-22 4/200 2026-03-25 11:25 by userper
[考研] 材料调剂 +6 匹克i 2026-03-23 6/300 2026-03-24 21:09 by greychen00
[考研] 求调剂 +5 林之夕 2026-03-24 5/250 2026-03-24 17:16 by dick_runner
[考研] 344求调剂 +3 desto 2026-03-24 3/150 2026-03-24 10:09 by 搏击518
[考研] 335求调剂 +4 yuyu宇 2026-03-23 5/250 2026-03-23 23:49 by Txy@872106
[考研] 化学308分求调剂 +3 你好明天你好 2026-03-23 3/150 2026-03-23 20:11 by macy2011
[考研] 070300，一志愿北航320求调剂 +3 Jerry0216 2026-03-22 5/250 2026-03-23 09:16 by 。。堂堂
[考研] 293求调剂 +3 涛涛Wjt 2026-03-22 5/250 2026-03-22 22:21 by jiangpengfei
[考研] 求调剂 +5 Zhangbod 2026-03-21 7/350 2026-03-22 13:13 by Zhangbod
[考研] 一志愿南大，0703化学，分数336，求调剂 +3 收到VS 2026-03-21 3/150 2026-03-21 18:42 by 学员8dgXkO
[考研] 296求调剂 +4 www_q 2026-03-20 4/200 2026-03-21 17:26 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境总分308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-20 7/350 2026-03-21 16:36 by barlinike
[考研] 一志愿西南交通 专硕 材料355 本科双非 求调剂 +5 西南交通专材355 2026-03-19 5/250 2026-03-20 21:10 by JourneyLucky
[考研] 086500 325 求调剂 +3 领带小熊 2026-03-19 3/150 2026-03-20 18:38 by 尽舜尧1
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭