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ccwhhs

铜虫 (正式写手)

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[求助] 请教用dmol跑团簇的分子动力学,如何分析稳定性

用dmol3跑一个团簇的分子动力学，用NVT系综，300K，如果经过几PS时间，团簇结构变形，那么该团簇稳定吗？
或者说初始结构能够保持几PS时间能说明它在常温下稳定？

[ Last edited by ccwhhs on 2011-4-24 at 07:23 ]

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1楼 2011-04-23 12:10:51

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ccwhhs

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引用回帖:

3楼: Originally posted by zsl_321123 at 2011-08-01 09:57:30:
your cluster is thermally unstable，

另外，不知道是否跟你的设置有关系。可以把你的详细设置列出来，让大家帮你分析分析。例如你用NVT，那么热浴的选择等。。。。

以下是设置的参数，不知设置正确不？
# Task parameters
Calculate                   molecular_dynamics
Write_HIS_File       on
Write_ARC_File       on
MD_Velocity          random
MD_Time_Step       0.5000
MD_Simann_panel
10000    NVT_NH    300.0000 2.0000
#

# Electronic parameters
Spin_polarization          unrestricted
Charge                      0
Basis                      dnp
Dftd                         obs
Pseudopotential             none
Functional                   gga(p91)
Aux_density                octupole
Integration_grid             fine
Occupation                   thermal 0.0050
Cutoff_Global                5.4000 angstrom
Scf_density_convergence    1.0000e-006
Scf_charge_mixing          0.2000
Scf_spin_mixing             0.5000
Scf_iterations             1000
Scf_diis                   6 pulay