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请教用dmol跑团簇的分子动力学,如何分析稳定性
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用dmol3跑一个团簇的分子动力学，用NVT系综，300K，如果经过几PS时间，团簇结构变形，那么该团簇稳定吗？ 或者说初始结构能够保持几PS时间能说明它在常温下稳定？ [ Last edited by ccwhhs on 2011-4-24 at 07:23 ] |
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2楼2011-04-24 08:08:18
3楼2011-08-01 09:57:30
送鲜花一朵 |
以下是设置的参数，不知设置正确不？ # Task parameters Calculate molecular_dynamics Write_HIS_File on Write_ARC_File on MD_Velocity random MD_Time_Step 0.5000 MD_Simann_panel 10000 NVT_NH 300.0000 2.0000 # # Electronic parameters Spin_polarization unrestricted Charge 0 Basis dnp Dftd obs Pseudopotential none Functional gga(p91) Aux_density octupole Integration_grid fine Occupation thermal 0.0050 Cutoff_Global 5.4000 angstrom Scf_density_convergence 1.0000e-006 Scf_charge_mixing 0.2000 Scf_spin_mixing 0.5000 Scf_iterations 1000 Scf_diis 6 pulay  |
4楼2011-08-01 11:53:39
5楼2011-08-23 15:03:34
6楼2012-03-05 10:59:50
xiaoboy185
金虫 (正式写手)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 788
- 散金: 248
- 红花: 3
- 帖子: 702
- 在线: 472.3小时
- 虫号: 481831
- 注册: 2007-12-19
- 专业: 函数论
7楼2012-03-05 12:54:00
木木__Chen
铜虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 843.9
- 帖子: 83
- 在线: 28.6小时
- 虫号: 5258227
- 注册: 2016-11-19
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
8楼2017-11-02 14:48:11
