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pidou213

木虫 (正式写手)


[交流] 【求助/交流】请问如何用NCBI进行进化树和同源性比较?

请问如何用NCBI进行进化树和同源性比较?

期待高人,先谢谢了
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zg939427605

铜虫 (小有名气)


引用回帖:
7楼: Originally posted by wenxu6699 at 2013-12-02 14:29:24
请问你做进化树时怎么选择序列啊...

blast
8楼2015-09-15 18:57:33
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swingman8

金虫 (著名写手)


pidou213(金币+1): 有同感,我也不会分析 2011-04-15 23:00:11
pidou213(金币+1): 2011-08-06 14:10:21
NCBI,用blast寻找相似序列,只能说是相似性比较,用软件构件进化树才能分析同源性,应该是这样,我现在的问题是会画树,不会分析,急死人啊
2楼2011-04-15 10:17:51
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新人小玥

木虫 (正式写手)


★ ★
西瓜(金币+2): 鼓励 2011-04-16 23:43:33
pidou213(金币+1): 我也是不会分析 ,还请指教 2011-04-18 18:02:02
用clusterW或clusterX进行多重比对,得到的数据可以用MAGA来做树。
不过听说现在最流行的是用PUMP,目前还不知道怎么用。

上述可以用DNAMAN可以实现哦,不过做出来的图不是很漂亮就是了。MAGA做的比较漂亮。
3楼2011-04-16 22:55:03
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pidou213

木虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by swingman8 at 2011-04-15 10:17:51:
NCBI,用blast寻找相似序列,只能说是相似性比较,用软件构件进化树才能分析同源性,应该是这样,我现在的问题是会画树,不会分析,急死人啊

我也是不会分析 ,还请指教
4楼2011-04-18 18:01:50
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