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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】请问如何用NCBI进行进化树和同源性比较？
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pidou213

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】请问如何用NCBI进行进化树和同源性比较？

请问如何用NCBI进行进化树和同源性比较？

期待高人，先谢谢了
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1楼 2011-04-14 15:30:34
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pidou213

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 新人小玥 at 2011-04-16 22:55:03:
用clusterW或clusterX进行多重比对，得到的数据可以用MAGA来做树。
不过听说现在最流行的是用PUMP，目前还不知道怎么用。

上述可以用DNAMAN可以实现哦，不过做出来的图不是很漂亮就是了。MAGA做的比较漂亮。

我也是不会分析 ，还请指教
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5楼2011-04-18 18:02:07
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swingman8

金虫 (著名写手)
pidou213(金币+1): 有同感，我也不会分析 2011-04-15 23:00:11
pidou213(金币+1): 2011-08-06 14:10:21
NCBI，用blast寻找相似序列，只能说是相似性比较，用软件构件进化树才能分析同源性，应该是这样，我现在的问题是会画树，不会分析，急死人啊
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2楼2011-04-15 10:17:51
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新人小玥

木虫 (正式写手)
★ ★
西瓜(金币+2): 鼓励 2011-04-16 23:43:33
pidou213(金币+1): 我也是不会分析 ，还请指教 2011-04-18 18:02:02
用clusterW或clusterX进行多重比对，得到的数据可以用MAGA来做树。
不过听说现在最流行的是用PUMP，目前还不知道怎么用。

上述可以用DNAMAN可以实现哦，不过做出来的图不是很漂亮就是了。MAGA做的比较漂亮。
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-04-16 22:55:03
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pidou213

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by swingman8 at 2011-04-15 10:17:51:
NCBI，用blast寻找相似序列，只能说是相似性比较，用软件构件进化树才能分析同源性，应该是这样，我现在的问题是会画树，不会分析，急死人啊

我也是不会分析 ，还请指教
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4楼2011-04-18 18:01:50
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