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【求助/交流】请问如何用NCBI进行进化树和同源性比较?
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pidou213
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【求助/交流】请问如何用NCBI进行进化树和同源性比较?
请问如何用NCBI进行进化树和同源性比较?
期待高人,先谢谢了
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2011-04-14 15:30:34
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Originally posted by
新人小玥
at 2011-04-16 22:55:03:
用clusterW或clusterX进行多重比对,得到的数据可以用MAGA来做树。
不过听说现在最流行的是用PUMP,目前还不知道怎么用。
上述可以用DNAMAN可以实现哦,不过做出来的图不是很漂亮就是了。MAGA做的比较漂亮。
我也是不会分析 ,还请指教
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2011-04-18 18:02:07
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pidou213(金币+1): 有同感,我也不会分析 2011-04-15 23:00:11
pidou213(金币+1): 2011-08-06 14:10:21
NCBI,用blast寻找相似序列,只能说是相似性比较,用软件构件进化树才能分析同源性,应该是这样,我现在的问题是会画树,不会分析,急死人啊
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2011-04-15 10:17:51
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西瓜(金币+2): 鼓励 2011-04-16 23:43:33
pidou213(金币+1): 我也是不会分析 ,还请指教 2011-04-18 18:02:02
用clusterW或clusterX进行多重比对,得到的数据可以用MAGA来做树。
不过听说现在最流行的是用PUMP,目前还不知道怎么用。
上述可以用DNAMAN可以实现哦,不过做出来的图不是很漂亮就是了。MAGA做的比较漂亮。
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2011-04-16 22:55:03
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swingman8
at 2011-04-15 10:17:51:
NCBI,用blast寻找相似序列,只能说是相似性比较,用软件构件进化树才能分析同源性,应该是这样,我现在的问题是会画树,不会分析,急死人啊
我也是不会分析 ,还请指教
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2011-04-18 18:01:50
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