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649251126

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】做过巯基DNA接金胶的，有经验的请进啊！

实验时将两者混合，放摇床16小时，理论讲AU-S键可以结合。第二天发现金胶变色啦，实验没成功，做了好几次都悲催啦！该实验DNA和金胶有无比例要求？必须加活化剂TCEP吗？请求有经验的朋友指点一下，越详细越好，谢谢！
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1楼 2011-04-05 20:12:44
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649251126

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by Indicator83 at 2011-04-05 20:59:50:
你的DNA前期是否处理过呢，带有巯基的DNA是不能拿来直接使用的，用之前要用DTT打开其双硫键（比例为DNA：DTT摩尔浓度比为1：10-100都可），配制成一定浓度的储备液体，备用。
DNA和金胶的浓度并没有一定的比例要 ...

以前看文献有用TCEP活化的，但是效果并不是很好啊！问了些师兄师姐，大家说直接连就可以，有些文献也这么说的。感觉效果不好哈！能跟我具体说下你的步骤与注意事项吗？谢谢!
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3楼2011-04-06 12:17:17
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Indicator83

木虫 (初入文坛)
你的DNA前期是否处理过呢，带有巯基的DNA是不能拿来直接使用的，用之前要用DTT打开其双硫键（比例为DNA：DTT摩尔浓度比为1：10-100都可），配制成一定浓度的储备液体，备用。
DNA和金胶的浓度并没有一定的比例要求，要根据你的实验自己确定，毕竟一个金胶上接N个DNA和一个金胶接一个DNA比例差的就很大，参考具体文献吧。
我做的金胶和巯基DNA结合，就是摇床12小时，陈化12小时，整个过程避光。
由于金胶接DNA后会使金胶粒径变大，因此颜色会略有变化，因此不建议使用高浓度DNA，一半在10-6M这个浓度左右，至于金胶浓度，你还得自己斟酌。
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2楼2011-04-05 20:59:50
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Indicator83

木虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by 649251126 at 2011-04-06 06:17:17:
以前看文献有用TCEP活化的，但是效果并不是很好啊！问了些师兄师姐，大家说直接连就可以，有些文献也这么说的。感觉效果不好哈！能跟我具体说下你的步骤与注意事项吗？谢谢!

其实这还要具体看你买的哪家的DNA的，我们买的DNA要么是赛百盛的，要么是上海生工的，其实带有巯基的DNA巯基端都经过处理，直接用是肯定不行的，一定要经过DTT打断其双硫键，比如你要配置10-6M的溶液，那就是先配置10-4M的DTT缓冲溶液作为稀释溶液，稀释后在摇床上1小时，这时候巯基才露出，不是活化，然后在和金胶连接。可能是你前期处理问题，当然你师兄师姐们的意见也要参考。
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4楼2011-04-06 12:32:42
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649251126

铜虫 (小有名气)
又做了一次，感觉还可以，呵呵。看来加盐老化时快速摇很重要哈！
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5楼2011-04-19 10:35:53
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