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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【讨论】跑完MD后分析哪些东西啊？？？
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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匿名

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1楼 2011-03-29 14:27:27
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shengxiang

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御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-04-02 12:14:27
这个的话怎么说呢……要根据你的体系了~
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2楼2011-03-29 14:46:39
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superdirac

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ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-03-30 12:51:35
引用回帖:
Originally posted by 小蜗牛8728 at 2011-03-29 14:27:27:
跑完长时间的MD后，按照研究问题的需要，要分析结果。看了文献上有分析RMSD，HB，Rg，想请教一下还可以分析哪些啊？多谢啦

这个问题 问的。
你想知道什么呢？ 呵呵！　
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我认为，酒一口一口喝，路一步一步走~步子迈大了，喀~容易扯着蛋
3楼2011-03-29 15:02:38
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匿名

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4楼2011-03-29 16:00:25
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5楼2011-03-29 16:01:32
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superdirac

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ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-03-30 12:51:11
呵呵。
那你做模拟到底是为解决什么问题？
   没有问题的话，你模拟什么啊。
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我认为，酒一口一口喝，路一步一步走~步子迈大了，喀~容易扯着蛋
6楼2011-03-29 16:51:14
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ghcacj

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阿超

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一句话，三个字，看文献
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7楼2011-03-29 16:52:38
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shengxiang

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ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-03-30 12:50:40
其实你也看出来了，大家的意见都是看文献，其实就是这样的，就是参照人家的文献分析了哪些东西，而你自己要解决什么问题~~~这样才能说啊~
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8楼2011-03-29 19:21:36
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guanzhouxmc

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ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-04-01 12:27:59
看文献永远是进步的源泉，文献看多了想法就多。会有“接下来做什么”想法的说明文献看的不够多。
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9楼2011-03-31 14:29:04
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leigp

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zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-04-09 08:43:16
引用回帖:
Originally posted by 小蜗牛8728 at 2011-03-29 16:00:25:
对于蛋白质加溶剂这样的体系呢？可以分析哪些呢？

本人不是做蛋白质方面模拟的，个人感觉可以分析蛋白质结构，与溶剂的水合作用等。一般来说先有想法接下来才去设计采用的方案啊，你怎么正好相反啊，都确定采用分子模拟研究蛋白质了，却不知道研究什么。还是楼上说的那话，多看文献。加油
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希望多向各位学习！
10楼2011-04-08 17:30:23
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