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wuzunfeng416

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】有谁用过T-RFLP 的方法做真菌多样性的吗? 已有5人参与

想问下,如果做真菌多样性,方法是T-RFLP,选择引物为18s,出结果以后有数据库比对吗?我在MICA上没有见到相关数据库,在RDP里也没见到,想问问大家有没有相关信息分享下,谢谢
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wuzunfeng416

银虫 (小有名气)

真菌18s做t-rflp的话有数据库么?我只想知道这个
4楼2011-04-20 11:46:05
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小小木虫8580

金虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
rainwander(金币+1): 鼓励交流~~~ 2011-04-20 18:18:33
18S分辨率太低,一般用ITS来做吧
2楼2011-03-29 13:03:44
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xukewei

铁杆木虫 (正式写手)


rainwander(金币+1): 鼓励交流~~~ 2011-04-20 18:18:42
对数据库根本对不出来的,有-6~+6bp的误差,建议做克隆文库后模拟酶切
Do what you love and love what you do!Do more than you are paid for!
3楼2011-03-29 14:07:17
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xiadongliang

金虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
rainwander(金币+1): 鼓励交流~~~ 2011-04-20 18:18:55
相比细菌来说,真菌数据库是太少了,好像是没有关于真菌RFLP的数据库。
5楼2011-04-20 15:04:26
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