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【讨论】minimizer出现问题
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我用gromacs能量最小化一个格子中含有聚合物链的体系时出现 下面的提示：The optimal PME mesh load for parallel simulations is below 0.5 and for highly parallel simulations between 0.25 and 0.33, for higher performance, increase the cut-off and the PME grid spacing 不懂这是是什么意思，想问一下各位高手谁碰到过，能帮着解决一下吗？ 我的minimizer.mdp是： title = coo cpp = /usr/bin/cpp define = -DFLEXIBLE constraints = none integrator = steep dt = 0.01 nsteps = 50000 nstlist = 10 ns_type = grid rlist = 0.9 coulombtype = PME rcoulomb = 0.9 vdwtype = cut-off rvdw = 0.9 fourierspacing = 0.12 fourier_nx = 0 fourier_ny = 0 fourier_nz = 0 pme_order = 4 ewald_rtol = 1e-5 optimize_fft = yes emtol = 1000.0 emstep = 0.01 谢谢各位大侠！！ |
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