24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
汕头大学海洋科学接受调剂
查看: 3931  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

songxiao60

银虫 (小有名气)


[交流] 【求助】晶体结构解析求助

求助
晶体解完后,有三个H2O无法确定是否存在,在不命名者三个Q峰位O前检测的错误为:
Alert level A
PLAT043_ALERT_1_A Check Reported Molecular Weight ................     608.93      
PLAT078_ALERT_1_A No H-atoms, but _solution_hydrogens reported as        geom      
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......         O3     
PLAT601_ALERT_2_A Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .        530 A**3

加上这三个O后检测的错误为:
Alert level A
SHFSU01_ALERT_2_A  The absolute value of parameter shift to su ratio > 0.20
            Absolute value of the parameter shift to su ratio given   1.581
            Additional refinement cycles may be required.
PLAT080_ALERT_2_A Maximum Shift/Error ............................       1.58      
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......         O3     
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......         O4     
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......         O5     
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......         O6     
PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact  O1     ..  O4      ..       2.43 Ang.


现在不知道如何确定这3个Q峰是不是O,且 加上后 做完各项异性,椭球比其他的要怪异,(更大更扁.特向各位大牛求助!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冰雪香香茄

银虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by yytsnake at 2011-03-28 15:04:27
在INS文件中加入HTAB命令,精修后在LIS文件中有氢键列表和建议的H位置,可解决大部分问题。

您好,能否麻烦您帮我解个晶体啊?
   万分感谢
9楼2014-11-06 09:56:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

yytsnake

至尊木虫 (职业作家)


songxiao60(金币+1): 2011-03-27 09:42:27
songxiao60(金币+2): 2011-03-27 09:46:57
菜鸟之见,残留Q峰是否为O,一是看晶体生成过程中是否有水生成或有水存在。二是看Q峰的值有多大(2+),三是看指定为O后,周围有无生成H键的环境。
你的A类好象是说,精修没收敛,需加大循环次数。O没加H,应该加上H试试。
2楼2011-03-27 09:09:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

songxiao60

银虫 (小有名气)


谢谢您的回答,我的Q峰在+2左右,加上这3个o后 精修就不收敛了。晶体实在水溶液中生成的,其中的一个游离水是可以确定 但是其他的3个O加上之后 ,椭球有点怪异,且不收敛了。
3楼2011-03-27 09:45:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yytsnake

至尊木虫 (职业作家)



nash603(金币+1): 谢谢回贴交流! 2011-03-27 16:44:55
songxiao60(金币+3): 2011-03-28 14:09:13
椭球类似橄榄球倒是正常,因为水受其它的作用力较小,最大的只有H键了。只要给游离水加上H,再加大精修循环次数,应该是可以收敛的,在发帖之时,正学着给水加H呢,两个配位水和六个游离水,实在是很费功夫,还好,CHECKCIF的结果是A、B类消失了,只剩下C和G还有一堆。
4楼2011-03-27 14:06:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿鲁东大学071000生物学学硕初试分数276求调剂 +26 慕绝cc 2026-04-09 30/1500 2026-04-14 18:50 by 蔡苏阳
[考研] 一志愿211,化学310分,本科重点双非,求调剂 +24 努力奋斗112 2026-04-08 24/1200 2026-04-14 18:02 by lhj2009
[考研] 药学求调剂 +6 RussHu 2026-04-12 7/350 2026-04-14 15:16 by sxdj2
[考研] 305求调剂 +8 玛卡巴卡boom 2026-04-11 8/400 2026-04-14 09:04 by pengliang8036
[考研] 一志愿华南理工大学331分材料求调剂 +10 天下ww 2026-04-09 11/550 2026-04-13 23:25 by pies112
[基金申请] 2026 WR青拔 +3 冬日阳光CAS 2026-04-09 6/300 2026-04-13 18:40 by liuchb715
[基金申请] 有爆料,一个青年教师卖房得400万,然后换了一个四青帽子 +11 babu2015 2026-04-08 11/550 2026-04-13 16:33 by probebill
[考研] 一志愿085802 323分求调剂 +13 drizzle_9 2026-04-12 14/700 2026-04-13 10:26 by Faiz5552
[考研] 本科南方医科大学 一志愿985 药学学硕284分 求调剂 +5 弱水听文 2026-04-09 5/250 2026-04-12 13:16 by shengxi123
[考研] 291求调剂 +8 关忆北. 2026-04-11 8/400 2026-04-12 09:32 by 逆水乘风
[考研] 280求调剂 +13 wzzz王 2026-04-09 13/650 2026-04-12 00:31 by 勇攀高峰0126
[考研] 359求调剂 +5 胃痉挛累了 2026-04-11 5/250 2026-04-11 19:55 by lbsjt
[考研] 0859,337求调剂 +4 研s. 2026-04-10 4/200 2026-04-11 11:34 by caotw2020
[考研] 一志愿985机械学硕380求调剂 +5 关关雎鸠10 2026-04-11 5/250 2026-04-11 10:10 by 知念。A
[考研] 284求调剂 +12 archer.. 2026-04-10 13/650 2026-04-11 08:44 by zhq0425
[考研] 一志愿矿大,材料工程专硕314分,0856可调都可以 +15 无懈可击的巨人 2026-04-09 15/750 2026-04-10 18:10 by hmn_wj
[考研] 282,电气工程专业,求调剂,不挑专业 +9 jggshjkkm 2026-04-10 9/450 2026-04-10 14:55 by 逆水乘风
[考研] 085601初试330分找调剂 +10 流心奶黄包l 2026-04-09 10/500 2026-04-10 08:14 by Sammy2
[考研] 材料专硕(0856) 339分求调剂 +9 哈哈哈鹅哈哈哈 2026-04-09 10/500 2026-04-09 20:01 by Orcid
[考研] 331求调剂 +5 luoxin0706. 2026-04-08 5/250 2026-04-08 22:15 by zhouyuwinner
信息提示
请填处理意见