应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 【求助/交流】NCBI中的核酸序列方向？
61/1返回列表
查看: 4468  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

王有朝

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】NCBI中的核酸序列方向？

从5撇端到3撇端吗？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-03-22 14:58:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ljsh

铁杆木虫 (著名写手)
王有朝(金币+3): 2011-03-22 15:32:46
yes,you are right!
赞一下 回复此楼
2楼2011-03-22 15:14:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ls2046

铁杆木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
不一定，有人提交的是互补序列，要甄别啊
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-03-22 15:51:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

西瓜

荣誉版主 (知名作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
不一定的。下面举例说明：
1.“join”表示序列是正向的，即ATG的A位置在49060，TAA的末位A位置在41766。
gene            40960..41766
                     /locus_tag="F46C8.1"
                     /db_xref="WormBase:WBGene00018484"
CDS             join(40960..41015,41071..41180,41236..41357,41671..41766)
                  /locus_tag="F46C8.1"


2.complement表示序列是方向互补的，即27241-27243是TTA（TAA反向互补），28374-28376是CAT（ATG反向互补）。
gene            complement(27241..28376)
                     /gene="dpy-7"
                     /locus_tag="F46C8.6"
                     /db_xref="WormBase:WBGene00001069"
CDS             complement(join(27241..28041,28221..28376))
                     /gene="dpy-7"
                     /locus_tag="F46C8.6"
                     /standard_name="F46C8.6"
赞一下(5人) 回复此楼
4楼2011-03-22 18:35:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小母虫子

铁虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by 西瓜 at 2011-03-22 18:35:11
不一定的。下面举例说明：
1.“join”表示序列是正向的，即ATG的A位置在49060，TAA的末位A位置在41766。
gene            40960..41766
                     /locus_tag="F46C8.1"
                     /db_x ...

请问怎么根据 gene 项中的 /locus_tag="F46C8.6"查询到此基因的核苷酸序列呢？
赞一下 回复此楼
5楼2015-06-04 17:29:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Aileen_lee

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
最近看到一个序列
   CDS             join(75..2556,2556..4072)
                     /ribosomal_slippage
                     /codon_start=1
                     /product="ORF1ab"
                     /protein_id="AER30008.1"
                     /db_xref="GI:354682141"

感觉这个序列开始于75是不正确的，不是应该要求符合3n+1 的位置吗
赞一下 回复此楼
6楼2016-01-20 15:29:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 王有朝 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭